More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0133 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0133  histidine kinase  100 
 
 
482 aa  976    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  50.32 
 
 
603 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0803  histidine kinase  51.97 
 
 
718 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571523  hitchhiker  0.00843936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2974  histidine kinase  57.41 
 
 
298 aa  310  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.355012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3137  histidine kinase  56.65 
 
 
291 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4974  sensor histidine kinase  52.73 
 
 
299 aa  295  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4407  histidine kinase  53.85 
 
 
286 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.449221  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3740  histidine kinase  37.18 
 
 
616 aa  259  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2265  histidine kinase  37.07 
 
 
562 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.135939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0478  histidine kinase  37.09 
 
 
560 aa  236  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676006  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2797  histidine kinase  35.03 
 
 
583 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  34.4 
 
 
632 aa  223  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  34.2 
 
 
632 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 
1155 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 
1149 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
1155 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  41 
 
 
1482 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  34.24 
 
 
638 aa  206  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
1168 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  42.91 
 
 
1170 aa  203  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
1155 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  40.66 
 
 
1172 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
1143 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
1119 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
1214 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.05 
 
 
1816 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 
1177 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
1141 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 
1145 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 
1159 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
1037 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  36.63 
 
 
1392 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  38.78 
 
 
896 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  38.1 
 
 
896 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  38.44 
 
 
896 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  38.44 
 
 
896 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 
1163 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  38.44 
 
 
896 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  37.84 
 
 
896 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  38.44 
 
 
896 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 
1406 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.51 
 
 
1158 aa  188  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
1159 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  38.1 
 
 
896 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
1942 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  38.1 
 
 
896 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 
2107 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
896 aa  186  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
1303 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 
1203 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 
1165 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 
1160 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
1179 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 
1479 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
1038 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 
1195 aa  183  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 
1406 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
1400 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 
1137 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 
2099 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
1917 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
916 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4103  ATPase domain-containing protein  40.25 
 
 
1179 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.972573  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  39.54 
 
 
1137 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 
1458 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  39.05 
 
 
576 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.54 
 
 
2099 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  38.91 
 
 
1937 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  35.24 
 
 
1200 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.07 
 
 
1158 aa  177  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 
1478 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
1131 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
944 aa  176  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
1356 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5775  histidine kinase  29.72 
 
 
554 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.941039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 
1937 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1142 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
1194 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 
687 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 
1195 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
767 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
1839 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  38.78 
 
 
565 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
646 aa  172  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
1936 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
922 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 
920 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
817 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 
2010 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 
1853 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
1847 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
1857 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  34.74 
 
 
1278 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
1155 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  35.27 
 
 
1196 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
1937 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 
975 aa  170  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
2037 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
833 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 
1237 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>