More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4328 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1509  extracellular solute-binding protein  56.22 
 
 
539 aa  648    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000203418  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  55.19 
 
 
543 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
551 aa  1132    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  99.82 
 
 
551 aa  1129    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3355  extracellular solute-binding protein  56.29 
 
 
551 aa  610  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188345  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3994  extracellular solute-binding protein family 5  48.95 
 
 
541 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169157 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  47.7 
 
 
533 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  34.39 
 
 
501 aa  289  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  34.59 
 
 
501 aa  288  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  34.44 
 
 
529 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 
545 aa  262  1e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 
526 aa  261  2e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 
501 aa  259  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 
525 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11401  ABC transporter substrate-binding protein  33.54 
 
 
523 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 
499 aa  250  4e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11541  ABC transporter substrate-binding protein  31.47 
 
 
523 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11551  ABC transporter substrate-binding protein  31.27 
 
 
523 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11431  ABC transporter substrate-binding protein  32.72 
 
 
534 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.88428 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  30.33 
 
 
528 aa  242  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1060  ABC transporter substrate-binding protein  31.8 
 
 
523 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.543795  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15381  ABC transporter substrate-binding protein  31.38 
 
 
525 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.318492  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1959  ABC transporter substrate-binding protein  30 
 
 
535 aa  230  6e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0702  ABC transporter substrate-binding protein  29.88 
 
 
516 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0704  ABC transporter substrate-binding protein  31.76 
 
 
525 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08861  ABC transporter substrate-binding protein  30 
 
 
491 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0211  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  28.89 
 
 
544 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 
515 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0142  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  27.24 
 
 
551 aa  179  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 
534 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.41 
 
 
535 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.35 
 
 
521 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.35 
 
 
521 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.35 
 
 
521 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
521 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.16 
 
 
521 aa  157  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18040  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.9 
 
 
551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 
544 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.96 
 
 
520 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  28.13 
 
 
517 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.49 
 
 
541 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  25.71 
 
 
532 aa  146  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  24.29 
 
 
566 aa  144  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
535 aa  143  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
528 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3264  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 
550 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2455  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 
543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.71 
 
 
535 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  24.74 
 
 
520 aa  141  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  24.06 
 
 
589 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 
532 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.23 
 
 
505 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  25.51 
 
 
535 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  25.51 
 
 
535 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  24.14 
 
 
526 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.51 
 
 
535 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.51 
 
 
535 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  25.51 
 
 
535 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  25.51 
 
 
535 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  26.31 
 
 
575 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.51 
 
 
535 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
545 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.32 
 
 
509 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.76 
 
 
535 aa  137  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  24.76 
 
 
535 aa  137  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  24.76 
 
 
535 aa  137  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  24.38 
 
 
565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
538 aa  135  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 
523 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  25.94 
 
 
527 aa  134  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  25.73 
 
 
531 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 
535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  24.44 
 
 
516 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 
516 aa  131  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  24.5 
 
 
535 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.1 
 
 
526 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.77 
 
 
525 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
506 aa  131  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
521 aa  131  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
530 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
545 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 
531 aa  130  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  24.63 
 
 
516 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  24.63 
 
 
516 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 
516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.9 
 
 
526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 
506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 
544 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.9 
 
 
526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.9 
 
 
526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 
535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  24.63 
 
 
516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2724  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
544 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117295  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
516 aa  128  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
541 aa  128  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 
535 aa  128  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>