140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4113 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  100 
 
 
329 aa  678    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  100 
 
 
329 aa  678    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  74.15 
 
 
332 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  69.47 
 
 
328 aa  471  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  66.56 
 
 
335 aa  458  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  66.25 
 
 
337 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  62.93 
 
 
324 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  43.48 
 
 
364 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  46.25 
 
 
329 aa  269  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  46.13 
 
 
310 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  45.37 
 
 
319 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  46.13 
 
 
310 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  44.9 
 
 
310 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  45.78 
 
 
351 aa  263  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 
318 aa  262  6e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  42.3 
 
 
351 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  43.33 
 
 
337 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  42.55 
 
 
327 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  45.4 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  43.25 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  43.59 
 
 
314 aa  256  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  43.71 
 
 
317 aa  255  6e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  42.34 
 
 
352 aa  255  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  43.59 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  44.1 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  41.82 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  44.86 
 
 
320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  44.73 
 
 
314 aa  252  7e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  42.24 
 
 
332 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  38.89 
 
 
358 aa  251  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  45.48 
 
 
310 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  41.39 
 
 
351 aa  246  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  42.9 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  43.45 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  43.95 
 
 
311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  41.72 
 
 
316 aa  243  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  42.63 
 
 
314 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  44.01 
 
 
308 aa  243  3e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  41.93 
 
 
344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  43.37 
 
 
337 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  38.39 
 
 
338 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  37.94 
 
 
341 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  35.74 
 
 
335 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  33.77 
 
 
319 aa  188  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  33.77 
 
 
319 aa  186  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  24.23 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  24.27 
 
 
319 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  35.77 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  22.75 
 
 
384 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  27.95 
 
 
423 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  27.95 
 
 
423 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 
579 aa  52.8  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 
429 aa  52.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  25 
 
 
314 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  21.15 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  25.95 
 
 
561 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 
418 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  26.74 
 
 
391 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2548  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  27.22 
 
 
399 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  25.37 
 
 
354 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 
405 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 
396 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 
344 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 
480 aa  49.7  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 
326 aa  49.7  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  21.63 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 
389 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  26.88 
 
 
401 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  20 
 
 
368 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 
401 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 
440 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 
401 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.69 
 
 
387 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.39 
 
 
387 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 
800 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 
330 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 
1002 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 
345 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 
396 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 
468 aa  47  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 
377 aa  47  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  28.68 
 
 
383 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 
380 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 
380 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.04 
 
 
496 aa  46.2  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.09 
 
 
291 aa  46.2  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.134726  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  28 
 
 
595 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 
330 aa  46.2  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  21.6 
 
 
347 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 
410 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 
459 aa  46.2  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
491 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  22.5 
 
 
415 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>