203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3129 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  66.24 
 
 
560 aa  738    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  99.28 
 
 
558 aa  1145    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  100 
 
 
558 aa  1154    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  75.73 
 
 
561 aa  870    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  53.56 
 
 
555 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  49.42 
 
 
663 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  51.39 
 
 
581 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  52.12 
 
 
567 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  43.83 
 
 
614 aa  402  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  43.83 
 
 
614 aa  402  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  43.83 
 
 
614 aa  402  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  36.55 
 
 
677 aa  333  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2225  integrase catalytic subunit  64.45 
 
 
251 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5797  integrase catalytic subunit  53.71 
 
 
245 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 
480 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  28.57 
 
 
480 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  30.36 
 
 
497 aa  170  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  30.36 
 
 
497 aa  170  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  30.36 
 
 
497 aa  170  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  29.03 
 
 
481 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  28.6 
 
 
481 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  30.47 
 
 
468 aa  167  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  28.68 
 
 
618 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  29.75 
 
 
552 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  27.88 
 
 
630 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  27.73 
 
 
626 aa  148  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  30.62 
 
 
547 aa  148  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 
618 aa  147  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 
618 aa  147  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  26.26 
 
 
625 aa  146  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 
536 aa  144  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 
556 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 
556 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 
556 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 
556 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  27.45 
 
 
595 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  25.59 
 
 
616 aa  139  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  28.57 
 
 
611 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2185  transposase  37.21 
 
 
224 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  28.25 
 
 
548 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  28.92 
 
 
560 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  31.06 
 
 
509 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  31.06 
 
 
572 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  31.06 
 
 
562 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  25.3 
 
 
636 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  28.6 
 
 
541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  28.6 
 
 
541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  28.6 
 
 
541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  28.6 
 
 
541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  34.32 
 
 
382 aa  127  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 
551 aa  127  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  30.98 
 
 
554 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  25.39 
 
 
542 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  26.09 
 
 
677 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  26.39 
 
 
652 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  26.39 
 
 
652 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  26.39 
 
 
652 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  26.37 
 
 
614 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  25.4 
 
 
599 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  25.4 
 
 
599 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  24.65 
 
 
640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  26.27 
 
 
640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  30.22 
 
 
617 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  30.22 
 
 
617 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  30.31 
 
 
649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  30.08 
 
 
644 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  33.33 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  30.88 
 
 
810 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  25.38 
 
 
547 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  25 
 
 
632 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  29.76 
 
 
653 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  29.75 
 
 
497 aa  105  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  27.25 
 
 
550 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  27.98 
 
 
640 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  27.98 
 
 
640 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  24.89 
 
 
626 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  24.35 
 
 
715 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  24.35 
 
 
715 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  27.85 
 
 
560 aa  94.4  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  22.77 
 
 
651 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  26.44 
 
 
900 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  25.3 
 
 
733 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  26.44 
 
 
900 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  27.34 
 
 
636 aa  91.7  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  24.86 
 
 
665 aa  91.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  28.19 
 
 
718 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  25.39 
 
 
902 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  28.2 
 
 
907 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  29.92 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  25.91 
 
 
716 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  28.76 
 
 
709 aa  82.8  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 
905 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 
905 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 
905 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 
905 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 
905 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  30.29 
 
 
774 aa  80.9  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  25.71 
 
 
650 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  23.79 
 
 
728 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  27.04 
 
 
902 aa  78.2  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>