More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3321 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3321  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
259 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3449  extracellular solute-binding protein  46.8 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1138  extracellular solute-binding protein family 3  50.21 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1168  extracellular solute-binding protein family 3  50.21 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4307  family 1 extracellular solute-binding protein  44.8 
 
 
292 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0179  extracellular solute-binding protein family 3  46.09 
 
 
261 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.861568 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1276  extracellular solute-binding protein  43.97 
 
 
260 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  31.66 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.89 
 
 
286 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  31.95 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  31.82 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.78 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  30.45 
 
 
286 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.51 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.51 
 
 
276 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
271 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 
276 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.09 
 
 
276 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.09 
 
 
276 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.09 
 
 
276 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  28.09 
 
 
276 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  28.09 
 
 
276 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.09 
 
 
276 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  32.18 
 
 
283 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 
290 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
275 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  28.44 
 
 
324 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2434  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.67 
 
 
274 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
324 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 
332 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  28.26 
 
 
326 aa  99  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  25.97 
 
 
271 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 
276 aa  96.3  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  29.11 
 
 
278 aa  95.5  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.69 
 
 
273 aa  95.1  9e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  24.89 
 
 
340 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  26.81 
 
 
273 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.18 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2669  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
287 aa  92.8  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00514827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
292 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  30.86 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  25.41 
 
 
328 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  30.86 
 
 
268 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  26.25 
 
 
295 aa  92.4  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  32.32 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  27.59 
 
 
288 aa  91.3  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0664  surface antigen, CjaA  28.57 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0251747  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3379  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0252504  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  29.65 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  32.83 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  29.65 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.5 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  32.32 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.54 
 
 
256 aa  89  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 
341 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  29.15 
 
 
279 aa  89  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.46 
 
 
272 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  26.12 
 
 
323 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1835  extracellular solute-binding protein family 3  29.54 
 
 
262 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4667  extracellular solute-binding protein family 3  31.4 
 
 
364 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  26.85 
 
 
275 aa  88.6  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1624  extracellular solute-binding protein family 3  25.69 
 
 
344 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467611  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3092  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.559619  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1245  amino acid  31.05 
 
 
268 aa  87.8  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  27.63 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0520  amino acid  26.42 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  28.14 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  26.51 
 
 
290 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3988  extracellular solute-binding protein family 3  29.19 
 
 
350 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  26.5 
 
 
323 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4947  extracellular solute-binding protein family 3  27.09 
 
 
345 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0229057  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  31.44 
 
 
274 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1051  extracellular solute-binding protein family 3  26.77 
 
 
274 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.99 
 
 
300 aa  85.5  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
331 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
331 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3397  hypothetical protein  28.99 
 
 
345 aa  85.1  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167886  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0813  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  34.16 
 
 
271 aa  85.5  9e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.000000000481343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4179  extracellular solute-binding protein family 3  29.19 
 
 
350 aa  85.1  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  25.73 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3951  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.71 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.07 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  26.47 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2503  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321301  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2098  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0603168  normal  0.126386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0965  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 
280 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000439884  n/a   
 
 
 
NC_008463  PA14_14100  putative amino acid-binding protein  28.51 
 
 
341 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.111954  normal  0.0628834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  29.31 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1123  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00011354  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>