More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4947 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4947  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 345 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0229057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1624  extracellular solute-binding protein family 3  61.31 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2098  extracellular solute-binding protein  60.12 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0603168  normal  0.126386 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3397  hypothetical protein  44.84 
 
 		 345 aa  310  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167886  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0715  extracellular solute-binding protein family 3  38.68 
 
 		 362 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.337122 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2522  family 1 extracellular solute-binding protein  40.31 
 
 		 355 aa  260  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2062  extracellular solute-binding protein family 3  38.46 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2086  extracellular solute-binding protein family 3  38.46 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0740  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 		 356 aa  248  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1255  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.13 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1108  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.51 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0973  extracellular solute-binding protein  38.08 
 
 		 343 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.846042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1998  extracellular solute-binding protein  39.87 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1072  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 342 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3560  extracellular solute-binding protein  37.13 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.801082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4546  extracellular solute-binding protein  38.18 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4667  extracellular solute-binding protein family 3  38.66 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0149  extracellular solute-binding protein  39.87 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0394116  decreased coverage  0.0000000197566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4552  extracellular solute-binding protein  39.24 
 
 		 342 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3707  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.371845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1297  general amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.13 
 
 		 342 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0904  extracellular solute-binding protein  37.13 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.700259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0975  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.37 
 
 		 342 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0561977  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3988  extracellular solute-binding protein family 3  39.81 
 
 		 350 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4179  extracellular solute-binding protein family 3  39.2 
 
 		 350 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0338  extracellular solute-binding protein family 3  38.34 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000810551  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4428  extracellular solute-binding protein  37.13 
 
 		 342 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3587  extracellular solute-binding protein  40.26 
 
 		 345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0949603 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02361  hypothetical protein  37.21 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5870  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.41 
 
 		 340 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3462  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.74 
 
 		 341 aa  232  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3652  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.74 
 
 		 341 aa  232  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0438  extracellular solute-binding protein  37.74 
 
 		 341 aa  232  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3563  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.74 
 
 		 341 aa  232  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3754  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.74 
 
 		 341 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.248765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003418  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  38.44 
 
 		 342 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.49248  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4587  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.74 
 
 		 341 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1004  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  36.84 
 
 		 340 aa  232  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2557  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.02 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1760  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.1 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1563  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.14 
 
 		 341 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6377  extracellular solute-binding protein family 3  37.76 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1454  extracellular solute-binding protein  38.05 
 
 		 389 aa  229  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2946  extracellular solute-binding protein family 3  41.14 
 
 		 344 aa  229  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4393  extracellular solute-binding protein  38.41 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4094  extracellular solute-binding protein  39.46 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0267267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3857  extracellular solute-binding protein family 3  35.96 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164094  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2558  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  35.8 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1602  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.75 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1529  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14100  putative amino acid-binding protein  36.55 
 
 		 341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.111954  normal  0.0628834 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0847  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 		 367 aa  226  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2057  general L-amino acid-binding periplasmic protein precursor  37.91 
 
 		 342 aa  225  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2984  extracellular solute-binding protein  39.18 
 
 		 367 aa  225  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3701  extracellular solute-binding protein family 3  35.29 
 
 		 343 aa  225  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0741  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.65 
 
 		 343 aa  225  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2324  extracellular solute-binding protein  37.13 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4005  extracellular solute-binding protein  38.29 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0736  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.65 
 
 		 343 aa  225  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3923  putative amino-acid ABC transporter, substrate-binding protein  36.96 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0246  extracellular solute-binding protein  37.54 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2136  extracellular solute-binding protein  40.51 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1705  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.5 
 
 		 340 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.402619 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0229  extracellular solute-binding protein family 3  35.71 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03126  predicted amino-acid transporter subunit  37.79 
 
 		 305 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03077  hypothetical protein  37.79 
 
 		 305 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2899  extracellular solute-binding protein family 3  40.76 
 
 		 340 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.507436  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1809  extracellular solute-binding protein  38.73 
 
 		 353 aa  222  8e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1113  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.66 
 
 		 340 aa  222  9e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2822  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  35.42 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2818  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  35.74 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0890  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.53 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0948  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.53 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0120  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0233  extracellular solute-binding protein family 3  35.42 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2071  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 		 344 aa  220  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0757625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3606  extracellular solute-binding protein  39.37 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020858 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7860  extracellular solute-binding protein family 3  36.95 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4484  extracellular solute-binding protein  37.38 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1253  putative amino acid-binding protein  36.76 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2912  extracellular solute-binding protein  35.11 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.392971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1406  extracellular solute-binding protein  34.66 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2415  extracellular solute-binding protein  37.92 
 
 		 365 aa  215  9e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2549  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  34.02 
 
 		 350 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216585  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2832  extracellular solute-binding protein family 3  34.47 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2579  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.171917  normal  0.200935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2503  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.91 
 
 		 338 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1747  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.49 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.913718  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12151  ABC transporter for amino acids, substrate binding protein  35.82 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1420  extracellular solute-binding protein  36.3 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217844  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0393  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.49 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0323019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2551  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  36.62 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1695  extracellular solute-binding protein  35.53 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0207768  hitchhiker  0.000479364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0793  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.36 
 
 		 341 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0819733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2625  extracellular solute-binding protein  35.24 
 
 		 347 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0779  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5283  extracellular solute-binding protein family 3  34.74 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4673  extracellular solute-binding protein  34.42 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3679  extracellular solute-binding protein  33.43 
 
 		 345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2051  extracellular solute-binding protein  33.72 
 
 		 347 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>