111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1402 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1402  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 
190 aa  354  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  44.78 
 
 
730 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  44.52 
 
 
1426 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  43.24 
 
 
558 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  44.09 
 
 
2851 aa  74.7  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  42.46 
 
 
1421 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  46.09 
 
 
699 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  59.21 
 
 
2914 aa  63.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  42.24 
 
 
644 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  58.82 
 
 
344 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  63.77 
 
 
712 aa  57.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  58.33 
 
 
813 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  50.49 
 
 
643 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  38.1 
 
 
635 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  58.57 
 
 
585 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  42.86 
 
 
473 aa  54.7  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  32.54 
 
 
842 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  50 
 
 
523 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  47.44 
 
 
582 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  54.84 
 
 
283 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  57.14 
 
 
748 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  47.44 
 
 
587 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50.72 
 
 
689 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  51.76 
 
 
582 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  50 
 
 
382 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2472  triple helix repeat-containing collagen  37.09 
 
 
183 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  46.25 
 
 
835 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  52.86 
 
 
492 aa  51.2  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  57.14 
 
 
481 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  57.14 
 
 
478 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  51.43 
 
 
434 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  52.05 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
474 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  53.25 
 
 
936 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  43 
 
 
586 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  55.71 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  46.24 
 
 
439 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  47.14 
 
 
380 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  50.68 
 
 
466 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  47.95 
 
 
493 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  46.24 
 
 
437 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  52 
 
 
468 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  52 
 
 
403 aa  48.9  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  47.5 
 
 
319 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  46.24 
 
 
451 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  54.17 
 
 
1170 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  50.7 
 
 
459 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  51.19 
 
 
400 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
253 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  52.78 
 
 
951 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  57.53 
 
 
706 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  47.19 
 
 
436 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  46.24 
 
 
437 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  46.24 
 
 
437 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  55.56 
 
 
1580 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  45.71 
 
 
390 aa  48.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  46.24 
 
 
645 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  36.71 
 
 
717 aa  48.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  43.66 
 
 
524 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  59.46 
 
 
512 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  48.91 
 
 
1101 aa  47.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  56.16 
 
 
1147 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  46.05 
 
 
366 aa  47.8  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  43.62 
 
 
322 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  52.78 
 
 
1321 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  45.71 
 
 
240 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  33.65 
 
 
1408 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  48.42 
 
 
444 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  47.14 
 
 
299 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  55.71 
 
 
867 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  54.29 
 
 
1451 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  57.14 
 
 
1297 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  43.59 
 
 
445 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  50 
 
 
347 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  45.83 
 
 
462 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  50 
 
 
347 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  41.18 
 
 
258 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  52.13 
 
 
1168 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  48.1 
 
 
542 aa  46.2  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  50 
 
 
288 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  43.75 
 
 
438 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  47.14 
 
 
426 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  47.76 
 
 
307 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  46.84 
 
 
442 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  40 
 
 
300 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  45.07 
 
 
252 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  46.88 
 
 
300 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  50 
 
 
838 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  52.46 
 
 
580 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  46.05 
 
 
308 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  43.84 
 
 
815 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  44.44 
 
 
469 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  60.38 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  54.29 
 
 
835 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  47.22 
 
 
1219 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  44.44 
 
 
647 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  45.21 
 
 
1055 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1937  triple helix repeat-containing collagen  38.46 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402337  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2409  hypothetical protein  37.5 
 
 
248 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242823  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  39.42 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>