More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0291 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0291  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  674    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3909  hypothetical protein  49.51 
 
 
330 aa  317  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0596  hypothetical protein  31.97 
 
 
346 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.096367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  31.08 
 
 
321 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  29.47 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  29.47 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  29.12 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  28.25 
 
 
318 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  31.16 
 
 
332 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  30.23 
 
 
334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  29.57 
 
 
325 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  31.06 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  31.16 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  28.88 
 
 
331 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  29.68 
 
 
322 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  28.43 
 
 
326 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  29.77 
 
 
322 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  35.65 
 
 
330 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  29.41 
 
 
332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  26.83 
 
 
323 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  28.26 
 
 
325 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  29.76 
 
 
325 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21240  hypothetical protein  27.85 
 
 
318 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00058939  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  29.53 
 
 
333 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  28.76 
 
 
328 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  27.97 
 
 
327 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  31.85 
 
 
334 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  29.29 
 
 
331 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  29.43 
 
 
341 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  30.51 
 
 
322 aa  123  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  28.12 
 
 
322 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  30.24 
 
 
325 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0073  hypothetical protein  29.51 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485967  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  27.53 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  26.93 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  26.1 
 
 
331 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  27.49 
 
 
318 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  29.81 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  29.59 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  28.18 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  27.3 
 
 
338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  26.8 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  29.21 
 
 
324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  27.72 
 
 
339 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  28.15 
 
 
326 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4274  hypothetical protein  29.37 
 
 
318 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0445604  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  29.09 
 
 
351 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  29.59 
 
 
364 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1128  putative tricarboxylate transporter, periplasmic ligand binding protein (TctC subunit))  31.08 
 
 
328 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  26.92 
 
 
330 aa  119  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  29.64 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  28.66 
 
 
310 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  27 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  27.89 
 
 
332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  32.26 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  27.53 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  28.12 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  27.94 
 
 
331 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  30.7 
 
 
341 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  25.75 
 
 
322 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  25.93 
 
 
327 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  26.23 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  26.21 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  27.72 
 
 
326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  27.21 
 
 
325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  28.53 
 
 
329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  28.71 
 
 
337 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  31.27 
 
 
321 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  30 
 
 
328 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  28.61 
 
 
344 aa  116  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  26.44 
 
 
327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  27.43 
 
 
350 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  33.2 
 
 
341 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  26.6 
 
 
326 aa  115  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  28.35 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  26.37 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  30.64 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  27.43 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1019  hypothetical protein  29.18 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  26.37 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  29.57 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  27.48 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03750  extra-cytoplasmic solute receptor, Bug family  28.52 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.549978  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  27.12 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  27.61 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  24.82 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  31.71 
 
 
316 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  27.57 
 
 
337 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  25.86 
 
 
332 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3047  hypothetical protein  28.91 
 
 
319 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  27.65 
 
 
324 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  28.29 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  26.51 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  29.59 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  28.4 
 
 
346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  31.71 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  26.43 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  27.78 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  29.15 
 
 
326 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  28.2 
 
 
327 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>