More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5642 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  57.83 
 
 		 553 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  58.56 
 
 		 553 aa  678    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  57.06 
 
 		 554 aa  653    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  55.8 
 
 		 554 aa  659    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  54.92 
 
 		 579 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  57.8 
 
 		 554 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  76.44 
 
 		 541 aa  885    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  58.75 
 
 		 553 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5642  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 540 aa  1126    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000211534  normal  0.444192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  56.8 
 
 		 555 aa  655    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  53.78 
 
 		 554 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  52.32 
 
 		 570 aa  619  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  51.11 
 
 		 544 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  49.63 
 
 		 543 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  46.3 
 
 		 521 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  45.29 
 
 		 548 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  45.93 
 
 		 552 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  45.94 
 
 		 558 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  46.27 
 
 		 564 aa  485  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  45.76 
 
 		 548 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  45.57 
 
 		 556 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  46.13 
 
 		 559 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  43.81 
 
 		 540 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  45.2 
 
 		 559 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  46.35 
 
 		 563 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  45.02 
 
 		 559 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  44.07 
 
 		 548 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  45.02 
 
 		 559 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  42.22 
 
 		 551 aa  436  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  40.19 
 
 		 1123 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  41.51 
 
 		 1100 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  42.94 
 
 		 544 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  39.89 
 
 		 1121 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  39.89 
 
 		 1092 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  40.37 
 
 		 1061 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  40.45 
 
 		 556 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  40.45 
 
 		 1088 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  41.25 
 
 		 682 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  40.33 
 
 		 1093 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  40.67 
 
 		 601 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  39.71 
 
 		 1114 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  40.45 
 
 		 1088 aa  415  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  39.81 
 
 		 1100 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  40.04 
 
 		 1094 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  39.96 
 
 		 1093 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  42.94 
 
 		 1108 aa  412  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  39.81 
 
 		 1088 aa  412  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  39.89 
 
 		 1121 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  39.81 
 
 		 1104 aa  412  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  40.48 
 
 		 1110 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  40.78 
 
 		 1102 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  40.77 
 
 		 591 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  38.82 
 
 		 1101 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  42.16 
 
 		 551 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  40 
 
 		 1088 aa  411  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  41.22 
 
 		 553 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  40.07 
 
 		 1088 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  40.86 
 
 		 1102 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  40.26 
 
 		 1098 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  39.81 
 
 		 1101 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  40.86 
 
 		 1102 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  42.25 
 
 		 1139 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3106  trehalose synthase  41.4 
 
 		 535 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151531  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  40.55 
 
 		 556 aa  406  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  40.71 
 
 		 1131 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  40.71 
 
 		 1131 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  40.71 
 
 		 1131 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  40.71 
 
 		 1131 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  40.15 
 
 		 572 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  39.63 
 
 		 1088 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  40.71 
 
 		 1131 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  38.55 
 
 		 1085 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  39.81 
 
 		 1160 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  40.37 
 
 		 1106 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  39.44 
 
 		 1137 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  39.07 
 
 		 1137 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  40.52 
 
 		 1131 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  40.11 
 
 		 606 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  38.89 
 
 		 1100 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  40.37 
 
 		 1099 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  39.44 
 
 		 1100 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  41.33 
 
 		 1116 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  40.88 
 
 		 1100 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  39.44 
 
 		 1137 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  39.89 
 
 		 1130 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  39.07 
 
 		 1137 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  40.33 
 
 		 1100 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  39.44 
 
 		 1137 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  40.26 
 
 		 571 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  41.53 
 
 		 1116 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  40.26 
 
 		 1100 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  39.82 
 
 		 1106 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  39.15 
 
 		 1108 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  39.26 
 
 		 572 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  39.96 
 
 		 1098 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  39.26 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  39.44 
 
 		 1164 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  39.44 
 
 		 1100 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  38.26 
 
 		 1112 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  37.89 
 
 		 1109 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>