More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5584 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 472 aa  943    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  63.98 
 
 		 474 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  60.25 
 
 		 473 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  60.65 
 
 		 469 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  58.66 
 
 		 499 aa  549  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  53.67 
 
 		 490 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  49.3 
 
 		 522 aa  442  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  36.42 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  33.67 
 
 		 485 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  35.68 
 
 		 473 aa  240  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  32.98 
 
 		 461 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 		 495 aa  234  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  34.04 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  35.04 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  33.4 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  32.07 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  30.74 
 
 		 447 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  32.7 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  32.61 
 
 		 440 aa  191  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  30.53 
 
 		 447 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  30.23 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  28.91 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  28.69 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  28.69 
 
 		 438 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  28.91 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 440 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  28.69 
 
 		 438 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 440 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  28.69 
 
 		 438 aa  171  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  28.69 
 
 		 438 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  28.48 
 
 		 438 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  29.04 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  31.15 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  28.75 
 
 		 443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  27.39 
 
 		 458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  27.64 
 
 		 452 aa  163  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  28.06 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  26.82 
 
 		 609 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  27.6 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  26.01 
 
 		 580 aa  134  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  28.6 
 
 		 480 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  27.85 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1754  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 474 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 494 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  25.68 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  26.51 
 
 		 445 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 445 aa  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  26.51 
 
 		 445 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  26.51 
 
 		 462 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  26.51 
 
 		 462 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  26.57 
 
 		 445 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  26.1 
 
 		 462 aa  110  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 445 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  23.66 
 
 		 503 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  23.44 
 
 		 471 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 522 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.05 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  27.43 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  24.17 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  24.12 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  23.03 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  24.95 
 
 		 451 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  24.58 
 
 		 476 aa  103  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 543 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  27.23 
 
 		 541 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  27.33 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08538  amino acid transporter (Eurofung)  21.89 
 
 		 507 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  24.15 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.92 
 
 		 486 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0542  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 465 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  23.65 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  22.2 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  23 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 494 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 495 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  23.06 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13282  cationic amino acid transport integral membrane protein  24.89 
 
 		 495 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.260226 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  23.06 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  23.06 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0697  amino acid permease family protein  24.26 
 
 		 465 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 		 503 aa  100  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  22.41 
 
 		 471 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  23.44 
 
 		 471 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  26.76 
 
 		 519 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>