282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3000 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  100 
 
 		 549 aa  1135    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6320  resolvase domain protein  34.1 
 
 		 553 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2949  site-specific recombinase  28.14 
 
 		 479 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764647  unclonable  0.00000628307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  28.05 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  24.4 
 
 		 516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  24.59 
 
 		 525 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  24.08 
 
 		 539 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  26.1 
 
 		 493 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  23.88 
 
 		 568 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  24.22 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  27.27 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5133  Resolvase domain  22.67 
 
 		 539 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.880179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  21.18 
 
 		 542 aa  99.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  28.19 
 
 		 542 aa  97.4  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  28.19 
 
 		 554 aa  97.8  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.63 
 
 		 613 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  21.58 
 
 		 524 aa  93.2  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  22.97 
 
 		 526 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.37 
 
 		 515 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.48 
 
 		 447 aa  90.5  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.37 
 
 		 506 aa  88.2  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  27.83 
 
 		 489 aa  87.4  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.34 
 
 		 475 aa  87.8  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  22.47 
 
 		 558 aa  87  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.7 
 
 		 563 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  28.35 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.76 
 
 		 517 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  21.7 
 
 		 555 aa  85.9  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  21.62 
 
 		 550 aa  84.3  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  23.53 
 
 		 519 aa  83.2  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  26.39 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  23.81 
 
 		 525 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  23.54 
 
 		 525 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.19 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  28.69 
 
 		 561 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  24.82 
 
 		 545 aa  80.9  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.35 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.48 
 
 		 548 aa  80.5  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.29 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.01 
 
 		 510 aa  80.1  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  26.8 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  26.01 
 
 		 534 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.76 
 
 		 515 aa  80.1  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.29 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  22.68 
 
 		 561 aa  79  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  28.25 
 
 		 522 aa  79.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  28.24 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.59 
 
 		 546 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  24.32 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  30.19 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  22.82 
 
 		 534 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  25.79 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  24.63 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.57 
 
 		 547 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  23.51 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  22.59 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  26.43 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  24.63 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  24.26 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  26.27 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  24.85 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.49 
 
 		 542 aa  77  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.49 
 
 		 542 aa  77  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  22.49 
 
 		 542 aa  76.6  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  31.21 
 
 		 555 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.66 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  24.31 
 
 		 568 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  29.65 
 
 		 551 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  23.21 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  21.41 
 
 		 546 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  30.23 
 
 		 540 aa  75.1  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  25.45 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  32.35 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  27.34 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  24.63 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  22.38 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  23.79 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  24.55 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 565 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  26.62 
 
 		 443 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  26.17 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  27.37 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  22.41 
 
 		 665 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.42 
 
 		 509 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  27.47 
 
 		 579 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  25.66 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  28.75 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  25.67 
 
 		 295 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.86 
 
 		 504 aa  72.8  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  30.51 
 
 		 537 aa  72  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25.08 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  22.63 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  22.13 
 
 		 743 aa  71.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  25.83 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  23.08 
 
 		 540 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  22.57 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  27.62 
 
 		 321 aa  69.7  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  21.56 
 
 		 460 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  23.34 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  23.73 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>