116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2956 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 764 aa  1587    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  34.85 
 
 		 795 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  33.87 
 
 		 797 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  31.92 
 
 		 768 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  31.55 
 
 		 901 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  32.02 
 
 		 753 aa  358  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  32.55 
 
 		 769 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  30.46 
 
 		 778 aa  333  6e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  31.63 
 
 		 775 aa  331  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  30.52 
 
 		 759 aa  329  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  31.16 
 
 		 785 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.33 
 
 		 807 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  29.42 
 
 		 761 aa  324  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.54 
 
 		 784 aa  319  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  29.55 
 
 		 762 aa  317  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.26 
 
 		 771 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.77 
 
 		 827 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  32.35 
 
 		 784 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  30.74 
 
 		 790 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  29.7 
 
 		 747 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  30.74 
 
 		 790 aa  303  7.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  30.05 
 
 		 772 aa  303  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  29.51 
 
 		 780 aa  301  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  30.28 
 
 		 782 aa  300  8e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  29.55 
 
 		 976 aa  299  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  31.49 
 
 		 706 aa  293  7e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  30.28 
 
 		 758 aa  287  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  29.84 
 
 		 1075 aa  287  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  29.72 
 
 		 757 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  30.37 
 
 		 747 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  29.52 
 
 		 774 aa  283  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  28.86 
 
 		 742 aa  283  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  29.96 
 
 		 754 aa  278  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  29.06 
 
 		 771 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  30.18 
 
 		 986 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  29.31 
 
 		 760 aa  268  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  29.31 
 
 		 1089 aa  267  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  30.18 
 
 		 986 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.27 
 
 		 964 aa  266  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.18 
 
 		 955 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.18 
 
 		 955 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.18 
 
 		 986 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.18 
 
 		 986 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.18 
 
 		 986 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  29.62 
 
 		 751 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  30.09 
 
 		 961 aa  264  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  27.8 
 
 		 740 aa  263  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.34 
 
 		 769 aa  258  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  28.48 
 
 		 759 aa  257  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  28.98 
 
 		 943 aa  257  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  28.32 
 
 		 760 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  28.63 
 
 		 773 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  27.94 
 
 		 755 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  27.17 
 
 		 716 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  28.59 
 
 		 1084 aa  242  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  27.61 
 
 		 728 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  28.14 
 
 		 806 aa  238  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.96 
 
 		 771 aa  238  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  28.65 
 
 		 777 aa  237  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  27.88 
 
 		 808 aa  235  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  27.94 
 
 		 751 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  32.71 
 
 		 1465 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  25.96 
 
 		 749 aa  231  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  25.03 
 
 		 757 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  26.66 
 
 		 818 aa  228  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  26.75 
 
 		 818 aa  228  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  27.9 
 
 		 826 aa  226  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  28.01 
 
 		 877 aa  225  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  27.27 
 
 		 826 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  26.84 
 
 		 888 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  26 
 
 		 745 aa  221  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  29.35 
 
 		 899 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.4 
 
 		 886 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  26.4 
 
 		 886 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  26.4 
 
 		 886 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.4 
 
 		 819 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  29.4 
 
 		 819 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  29.4 
 
 		 819 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  25.89 
 
 		 741 aa  213  7.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.46 
 
 		 781 aa  213  9e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  27.34 
 
 		 1189 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  26.81 
 
 		 890 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  27.54 
 
 		 1114 aa  211  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  27.33 
 
 		 823 aa  209  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  27.01 
 
 		 811 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.49 
 
 		 753 aa  205  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  25.95 
 
 		 1124 aa  205  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  26.53 
 
 		 839 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.81 
 
 		 849 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  27.56 
 
 		 1426 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  26.32 
 
 		 821 aa  192  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  24.15 
 
 		 1322 aa  189  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  25.68 
 
 		 846 aa  187  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  24.94 
 
 		 1427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  25.13 
 
 		 1422 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  24.72 
 
 		 798 aa  177  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  24.16 
 
 		 802 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  26.98 
 
 		 754 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  24.83 
 
 		 901 aa  167  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06597  alpha-1,2-mannosidase  30.99 
 
 		 534 aa  154  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>