84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2814 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2814  hypothetical protein  100 
 
 		 1043 aa  2147    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.73 
 
 		 1217 aa  95.5  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  21.86 
 
 		 1229 aa  82  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1091  WD-40 repeat-containing protein  25.76 
 
 		 1402 aa  82  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  23.28 
 
 		 1211 aa  80.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6921  hypothetical protein  22.36 
 
 		 659 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1491 aa  65.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2012  WD-40 repeat-containing protein  22.61 
 
 		 1236 aa  62.4  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  23.18 
 
 		 1183 aa  62  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  41.54 
 
 		 1432 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  49.15 
 
 		 1583 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  32.46 
 
 		 1194 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2215  serine/threonine protein kinase  42.19 
 
 		 1152 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.62111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.43 
 
 		 1609 aa  59.3  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  30.58 
 
 		 1102 aa  59.3  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0174  hypothetical protein  29.06 
 
 		 787 aa  58.9  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.98 
 
 		 1623 aa  58.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 		 1353 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2549  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45 
 
 		 680 aa  57  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0511571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  44.83 
 
 		 972 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.6 
 
 		 1190 aa  55.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.34 
 
 		 1598 aa  55.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 		 897 aa  55.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 		 969 aa  55.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 		 969 aa  54.7  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 		 965 aa  54.7  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  40 
 
 		 1357 aa  54.7  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  44.44 
 
 		 1344 aa  54.7  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  38.03 
 
 		 1424 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  41.18 
 
 		 1401 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 		 1078 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.07 
 
 		 1398 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.07 
 
 		 1547 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.23 
 
 		 1617 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  37.1 
 
 		 1314 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.07 
 
 		 1607 aa  53.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1355 aa  53.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  38.71 
 
 		 1157 aa  53.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  35 
 
 		 1699 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.77 
 
 		 1684 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  39.68 
 
 		 947 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  24.18 
 
 		 1032 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 		 973 aa  52.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.07 
 
 		 1626 aa  52  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  37.7 
 
 		 1013 aa  51.6  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  40 
 
 		 1265 aa  51.6  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  40.3 
 
 		 885 aa  51.2  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  37.14 
 
 		 1089 aa  51.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.91 
 
 		 1599 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  37.14 
 
 		 1089 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  29.17 
 
 		 1067 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  29.17 
 
 		 1075 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.38 
 
 		 1686 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 1075 aa  50.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.57 
 
 		 1823 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  34.43 
 
 		 1046 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  30.89 
 
 		 1075 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 1080 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  34.62 
 
 		 1733 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 901 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1392 aa  50.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  30.89 
 
 		 1063 aa  49.7  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  24.74 
 
 		 1308 aa  49.7  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  38.71 
 
 		 1152 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1026 aa  49.3  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  30.83 
 
 		 1092 aa  48.5  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  25.94 
 
 		 994 aa  48.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5729  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 712 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  39.06 
 
 		 1124 aa  47.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.5 
 
 		 1711 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  35.14 
 
 		 902 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  30.97 
 
 		 1236 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  37.33 
 
 		 1131 aa  47  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  23.66 
 
 		 1264 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 		 1014 aa  46.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 		 698 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 		 1020 aa  46.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  23.66 
 
 		 1264 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  29.81 
 
 		 1552 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 		 1005 aa  46.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.29 
 
 		 1652 aa  45.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4962  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1136 aa  45.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.81 
 
 		 1760 aa  45.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.7 
 
 		 1240 aa  45.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>