96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2392 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2392  periplasmic binding protein  100 
 
 		 390 aa  796    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.191932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2078  periplasmic binding protein  26.49 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000011261 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4502  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.82 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4450  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.82 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4113  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.82 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4265  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.47 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4102  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.47 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4597  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.47 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4449  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.47 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0748  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.82 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4488  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.11 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  25.19 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  25.94 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4216  periplasmic binding protein  23.4 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  23.13 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  22.96 
 
 		 682 aa  57.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  24.04 
 
 		 338 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  26.81 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2356  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  26.94 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  22.64 
 
 		 682 aa  56.6  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0212  putative ferrichrome ABC transporter periplasmic-binding protein  23.24 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  26.91 
 
 		 332 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1180  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  25.23 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000254745  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 358 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  22.79 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0213  putative iron chelate uptake ABC transporter, solute-binding protein  23.24 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  22.26 
 
 		 323 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 		 351 aa  53.5  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  22.4 
 
 		 289 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  22.5 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.05 
 
 		 483 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 289 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0949  transferrin receptor  24.62 
 
 		 336 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0298481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  22.04 
 
 		 345 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  19.83 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  24.36 
 
 		 478 aa  50.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.36 
 
 		 344 aa  50.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  20.59 
 
 		 344 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  20.59 
 
 		 344 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  23.22 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2313  periplasmic binding protein  20.96 
 
 		 305 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  22.69 
 
 		 318 aa  49.7  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  21.45 
 
 		 306 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0582  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.55 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.818084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4374  periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4655  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.55 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  24.2 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4372  periplasmic binding protein  24.66 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.670262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25 
 
 		 293 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1790  periplasmic-binding protein  28.57 
 
 		 212 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4660  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.34 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1214  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0039818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  20.7 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1192  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.842601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4441  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.34 
 
 		 291 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4786  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.34 
 
 		 291 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2663  periplasmic binding protein  22.68 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4673  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.34 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4280  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.34 
 
 		 291 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0936488  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  20.94 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4291  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.34 
 
 		 291 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  22.33 
 
 		 318 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  19.86 
 
 		 323 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  23.95 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  22.96 
 
 		 379 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  23.57 
 
 		 297 aa  46.2  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  21.68 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16600  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  23.28 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  19.03 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 267 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  23.35 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  22.6 
 
 		 723 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0535  periplasmic binding protein  31.54 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  22.07 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  22.41 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  19.91 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  19.73 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  21.58 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  22.26 
 
 		 429 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  21.79 
 
 		 315 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2491  periplasmic binding protein  20.91 
 
 		 261 aa  44.3  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  22.02 
 
 		 309 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  21.79 
 
 		 315 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  22.94 
 
 		 287 aa  43.5  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  20.54 
 
 		 288 aa  43.5  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  23.14 
 
 		 353 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  21.61 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  22.44 
 
 		 723 aa  43.1  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  23.9 
 
 		 341 aa  43.1  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1764  periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 307 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  19.42 
 
 		 313 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>