292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1180 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1180  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000254745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4374  periplasmic binding protein  32.3 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.63 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4655  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.63 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4441  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.13 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4280  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.29 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0936488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4291  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.46 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0582  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.46 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.818084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4786  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.13 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4660  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.61 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2356  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  30.16 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4673  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.29 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0212  putative ferrichrome ABC transporter periplasmic-binding protein  33.11 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0213  putative iron chelate uptake ABC transporter, solute-binding protein  33.11 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1214  periplasmic binding protein  33.72 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0039818  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1192  periplasmic binding protein  33.72 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.842601  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4488  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.68 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0748  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.36 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  26.16 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  26.16 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  27.47 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  26.79 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  26.79 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  25.17 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4450  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.79 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4502  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.47 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4265  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.47 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4102  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.47 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4597  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.47 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4449  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.47 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4113  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.44 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4216  periplasmic binding protein  23.44 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.06 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.64 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  24 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2078  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000011261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3454  periplasmic binding protein  24.45 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0575769  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  25.34 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2392  periplasmic binding protein  25.7 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.191932  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  23.68 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.29 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  24.66 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0535  periplasmic binding protein  30.53 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5562  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.99 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2491  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  26.34 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.51 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.31 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  23.51 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.88 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.88 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  23.86 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  23.86 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  21.72 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0592  periplasmic binding protein  24.89 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  23.86 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  27.01 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  23.16 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4687  periplasmic binding protein  22.82 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0140247  hitchhiker  0.000000000756756 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  25.4 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1288  hypothetical protein  25.42 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.94 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  22.92 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  27.15 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  25.49 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.23 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0021  periplasmic binding protein  22.61 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0962  periplasmic binding protein  25 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  22.6 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4689  periplasmic binding protein  22.36 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.83 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  22.44 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  25 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4553  periplasmic binding protein  22.36 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697431  hitchhiker  0.000000125812 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 662 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  23.81 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2879  periplasmic binding protein  24.14 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  24 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  23.36 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1533  hypothetical protein  21.2 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0124  periplasmic binding protein  24.77 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00000158909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.36 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  24.76 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0745  periplasmic binding protein  22.84 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.124358  hitchhiker  0.00000000011582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  23.18 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  24.69 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  24.3 
 
 		 394 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  22.33 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  24.2 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1119  periplasmic binding protein  21.3 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00373301  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  23.77 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>