More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1520 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
674 aa  1353    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0527458  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.26 
 
 
666 aa  225  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1328  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.92 
 
 
658 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.23 
 
 
657 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3477  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.41 
 
 
606 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.26 
 
 
660 aa  181  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  27.38 
 
 
650 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  27.38 
 
 
650 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  26.86 
 
 
660 aa  177  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  25.84 
 
 
632 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  26.26 
 
 
658 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  26.86 
 
 
660 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  26.24 
 
 
660 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  25.97 
 
 
658 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  26.4 
 
 
658 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  26.4 
 
 
658 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.8 
 
 
677 aa  174  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000502143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  26.26 
 
 
658 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  27.04 
 
 
660 aa  173  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.92 
 
 
660 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  27.08 
 
 
626 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  25.48 
 
 
648 aa  171  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  25.91 
 
 
646 aa  171  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.75 
 
 
658 aa  170  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  25.53 
 
 
658 aa  170  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  24.14 
 
 
647 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  25.7 
 
 
646 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  27.48 
 
 
650 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.26 
 
 
659 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.738999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  25.6 
 
 
658 aa  170  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  25.56 
 
 
632 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  26.26 
 
 
658 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  25.79 
 
 
629 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.11 
 
 
658 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 
644 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.14 
 
 
647 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624074  hitchhiker  0.000681907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.86 
 
 
647 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  25.46 
 
 
660 aa  165  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  25.46 
 
 
660 aa  165  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  25.46 
 
 
660 aa  165  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  25.46 
 
 
660 aa  165  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  25.21 
 
 
660 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  25.68 
 
 
626 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.28 
 
 
648 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.44 
 
 
661 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  26.11 
 
 
658 aa  161  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  24.29 
 
 
630 aa  161  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  25.75 
 
 
660 aa  160  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  26.71 
 
 
652 aa  159  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  25.75 
 
 
660 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.81 
 
 
632 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  26.13 
 
 
660 aa  157  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.36 
 
 
565 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  27.21 
 
 
660 aa  156  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.83 
 
 
678 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.56 
 
 
676 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  25.92 
 
 
660 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.94 
 
 
664 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0344435  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.03 
 
 
630 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.72 
 
 
630 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  25.92 
 
 
660 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.77 
 
 
625 aa  154  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  25.92 
 
 
660 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.03 
 
 
630 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.94 
 
 
630 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.41 
 
 
630 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  24.64 
 
 
622 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.41 
 
 
630 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  25.92 
 
 
660 aa  154  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  24.27 
 
 
645 aa  154  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  25.53 
 
 
660 aa  154  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4841  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.2 
 
 
666 aa  153  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.26 
 
 
630 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.77 
 
 
636 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.41 
 
 
660 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.26 
 
 
630 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.7 
 
 
608 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  24.59 
 
 
629 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.36 
 
 
638 aa  150  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  26.51 
 
 
625 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  26.24 
 
 
627 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.62 
 
 
655 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.54 
 
 
609 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.78 
 
 
671 aa  148  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.04 
 
 
626 aa  147  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  26.53 
 
 
623 aa  147  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.27 
 
 
667 aa  147  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  24.31 
 
 
629 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0389  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.74 
 
 
587 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.074674  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.19 
 
 
655 aa  147  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.9 
 
 
452 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.86 
 
 
621 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  23.83 
 
 
629 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0365  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.97 
 
 
548 aa  145  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.61 
 
 
678 aa  146  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0897525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4739  methyl-accepting chemotaxis protein  24.52 
 
 
666 aa  145  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  26.23 
 
 
639 aa  145  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.29 
 
 
645 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  25.04 
 
 
660 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.61 
 
 
533 aa  144  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>