More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1098 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 482 aa  1004    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  53.57 
 
 		 479 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 513 aa  350  4e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 521 aa  345  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  40.12 
 
 		 520 aa  343  5e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  36.85 
 
 		 508 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  40.25 
 
 		 513 aa  332  8e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 		 508 aa  332  8e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  40.21 
 
 		 521 aa  329  6e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 507 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  41.41 
 
 		 435 aa  325  9e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  37.07 
 
 		 508 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  37.07 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  37.07 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  37.27 
 
 		 508 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  36.92 
 
 		 508 aa  319  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  37.07 
 
 		 508 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  36.46 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  36.38 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  36.46 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  37.63 
 
 		 510 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  36.25 
 
 		 508 aa  316  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  36.46 
 
 		 525 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  36.25 
 
 		 525 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 		 524 aa  287  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 604 aa  256  9e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 		 516 aa  242  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 508 aa  239  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 592 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 504 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 512 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 531 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 506 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 514 aa  205  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.54 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 526 aa  203  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 506 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  31.28 
 
 		 507 aa  200  6e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  34.29 
 
 		 394 aa  199  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 504 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 504 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 510 aa  196  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  28.86 
 
 		 504 aa  194  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 502 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 507 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 		 501 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 499 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 518 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 499 aa  177  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 		 503 aa  173  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  26.71 
 
 		 513 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.37 
 
 		 227 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 420 aa  94  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  24.8 
 
 		 427 aa  88.6  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 432 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  24.53 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3195  oxidoreductase  24.8 
 
 		 405 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3172  oxidoreductase  26.14 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  23.22 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3187  oxidoreductase, putative  28.82 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.70562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  24.27 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  22.93 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  23.2 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1211  oxidoreductase  25.46 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  22.93 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  22.93 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1233  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  23.42 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  23.12 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  23.69 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  22.63 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  23.31 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2421  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347894  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  23.17 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3449  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  23.42 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>