59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1034 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 185 aa  384  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  51.91 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  50.82 
 
 		 188 aa  204  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 		 194 aa  190  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  46.15 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  42.94 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 		 181 aa  88.2  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  27.62 
 
 		 182 aa  84.7  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  27.62 
 
 		 182 aa  84.7  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  24.24 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  25.99 
 
 		 548 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  21.69 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  22.56 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  24.34 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  25 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  24.1 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  25.32 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  24.43 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  23.46 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  26 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  21.79 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  25.26 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  27.7 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  24.85 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  19.46 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  24.52 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 351 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 341 aa  48.5  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 163 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  21.94 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  21.94 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  21.94 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  27.96 
 
 		 343 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  24.86 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  24.35 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  26.28 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  23.33 
 
 		 356 aa  45.1  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  22.58 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  28.79 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  23.72 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  28.57 
 
 		 308 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 326 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3885  hypothetical protein  23.46 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 283 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3917  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 		 158 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  19.66 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  23.97 
 
 		 149 aa  41.2  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>