More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0193 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0193  ABC transporter related  100 
 
 		 647 aa  1320    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  27.27 
 
 		 643 aa  170  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0192  ABC transporter related  27.16 
 
 		 597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000020543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  37.13 
 
 		 885 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  35.66 
 
 		 950 aa  159  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  26.1 
 
 		 662 aa  157  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  33.58 
 
 		 1130 aa  156  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.5 
 
 		 888 aa  154  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1614  ABC transporter related  41.36 
 
 		 244 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.045401 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1509  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein, putative  37.5 
 
 		 221 aa  151  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000891306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  33.11 
 
 		 655 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  40.09 
 
 		 224 aa  150  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  32 
 
 		 652 aa  150  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.5 
 
 		 230 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  37.44 
 
 		 261 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  34.26 
 
 		 641 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  32.6 
 
 		 661 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  34.93 
 
 		 1090 aa  148  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  34.48 
 
 		 779 aa  148  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  33.92 
 
 		 641 aa  147  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  37.09 
 
 		 241 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2328  ABC transporter related protein  37.81 
 
 		 226 aa  147  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  33.58 
 
 		 779 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  38.07 
 
 		 238 aa  147  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  37.33 
 
 		 232 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15650  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  35.32 
 
 		 244 aa  146  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0562  ABC transporter related  35.5 
 
 		 665 aa  145  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  37.04 
 
 		 225 aa  145  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  37.04 
 
 		 225 aa  145  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  24.1 
 
 		 658 aa  145  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  29.43 
 
 		 653 aa  145  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  39.7 
 
 		 255 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  28.17 
 
 		 660 aa  144  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  35.69 
 
 		 903 aa  144  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  29.52 
 
 		 652 aa  144  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  37.04 
 
 		 232 aa  144  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  39.2 
 
 		 259 aa  144  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.33 
 
 		 647 aa  143  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  34.27 
 
 		 643 aa  143  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  33.57 
 
 		 641 aa  143  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  31.03 
 
 		 654 aa  143  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  35.96 
 
 		 640 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  39.8 
 
 		 228 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23530  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  34.63 
 
 		 893 aa  143  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 238 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  38.01 
 
 		 229 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  30.51 
 
 		 652 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  39.9 
 
 		 232 aa  141  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1654  ABC transporter related  37.44 
 
 		 265 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5133  ABC transporter related  31.56 
 
 		 640 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.58 
 
 		 238 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.73 
 
 		 642 aa  141  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1563  ABC transporter related protein  36.57 
 
 		 223 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000128837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  30.64 
 
 		 656 aa  140  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  32.57 
 
 		 648 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  37.75 
 
 		 235 aa  140  6e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  40 
 
 		 241 aa  140  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  32.57 
 
 		 648 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  32.72 
 
 		 644 aa  140  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 		 243 aa  140  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  35.14 
 
 		 240 aa  140  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  35.96 
 
 		 233 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 233 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.35 
 
 		 665 aa  139  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  35.96 
 
 		 233 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  35.81 
 
 		 225 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33 
 
 		 232 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  35.96 
 
 		 233 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 		 233 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  35.35 
 
 		 315 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  38.79 
 
 		 236 aa  140  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1308  peptide ABC transporter ATPase  40.2 
 
 		 252 aa  140  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000199498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  35.96 
 
 		 233 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 		 233 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 		 233 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  36.32 
 
 		 234 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  38.19 
 
 		 232 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  38.54 
 
 		 234 aa  139  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  39.07 
 
 		 241 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  38.46 
 
 		 256 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  36.74 
 
 		 240 aa  139  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4598  ABC transporter related  37.39 
 
 		 293 aa  139  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0475  ABC transporter-related protein  35.53 
 
 		 228 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.761135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  37.2 
 
 		 227 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  38.19 
 
 		 239 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1484  ABC transporter related protein  36.23 
 
 		 216 aa  139  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  38.5 
 
 		 230 aa  138  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6965  ABC transporter related  37.38 
 
 		 248 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  37.78 
 
 		 266 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  36.11 
 
 		 233 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  35 
 
 		 678 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2375  ABC transporter related  35.35 
 
 		 225 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1047  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  34.63 
 
 		 233 aa  138  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1979  transporter  39.07 
 
 		 227 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  25.35 
 
 		 664 aa  138  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  31.6 
 
 		 649 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  29.71 
 
 		 643 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35 
 
 		 678 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  35 
 
 		 678 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.63 
 
 		 233 aa  138  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>