148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2145 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  63.18 
 
 
243 aa  299  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2473  protein of unknown function DUF541  71.73 
 
 
242 aa  275  5e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.065986  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1791  hypothetical protein  55.05 
 
 
237 aa  189  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  46.23 
 
 
236 aa  168  9e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  35.84 
 
 
240 aa  98.6  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  29.06 
 
 
245 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  35.84 
 
 
281 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  33.66 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  32.16 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  29.66 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  31.41 
 
 
220 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  28.7 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  29.72 
 
 
246 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  29.19 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  31.88 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  31.85 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  33.17 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  29.87 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  32.29 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  30.04 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  32.29 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  29.38 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  28.98 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  32.68 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  28.46 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  28.51 
 
 
251 aa  79  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  33.33 
 
 
242 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  31.75 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  32.85 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  27.67 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  26.76 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  29.22 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  31.65 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  29.75 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  27.05 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  29.93 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  30.07 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  28.67 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  24.48 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  29.93 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  24.48 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  28.67 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  29.93 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  29.8 
 
 
241 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  29.93 
 
 
223 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  29.8 
 
 
241 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  29.8 
 
 
241 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  24.89 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  27.57 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  28.11 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  25.93 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  28 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  27.9 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  27.62 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  22.55 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  28.16 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  26.46 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  30.86 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  26.07 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  29.2 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.31 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  28 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  28.76 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  26.26 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  25.59 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  28.76 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  34.84 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  32.34 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  26.04 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  32.75 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  26.6 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  27.01 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  28.19 
 
 
234 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  28.8 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  28.8 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  28.8 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  28.8 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  24.59 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  28.48 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  29.09 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  26.24 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  27.78 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  27.55 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  27.59 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  28.78 
 
 
247 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  27.92 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  25.67 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2298  protein of unknown function DUF541  30.77 
 
 
251 aa  62.4  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.568892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  29.86 
 
 
256 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  27.75 
 
 
242 aa  62.4  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  28.49 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  27.24 
 
 
243 aa  62  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  27.43 
 
 
258 aa  62  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  27.42 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  27.42 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  27.42 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  27.42 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  27.42 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>