109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0996 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  100 
 
 
389 aa  759    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 
376 aa  258  1e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0417  major facilitator transporter  40.7 
 
 
364 aa  245  9e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.117512  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  28.13 
 
 
395 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  28.61 
 
 
423 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2587  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  25.86 
 
 
416 aa  89  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  24.32 
 
 
396 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25.2 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  28.12 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  28.12 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.2 
 
 
423 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  28.12 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  28.12 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  28.12 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25.27 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.66 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.24 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  27.83 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  28.12 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  23.38 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.76 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  28.49 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  27.54 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.89 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.44 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 
397 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  27.83 
 
 
397 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  27.75 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  22.62 
 
 
419 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.66 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  25.08 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  24.03 
 
 
393 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  24.03 
 
 
393 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  23.51 
 
 
413 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  23.42 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  25.31 
 
 
412 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  25.16 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  25.7 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  21.36 
 
 
419 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  22.25 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 
419 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  22.5 
 
 
410 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  22.48 
 
 
419 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  28.12 
 
 
394 aa  54.3  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  25.21 
 
 
416 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  26.86 
 
 
393 aa  53.5  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  26.86 
 
 
393 aa  52.8  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  26.86 
 
 
393 aa  52.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  23.29 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  28.38 
 
 
429 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  25.51 
 
 
405 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  22.77 
 
 
398 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  21.62 
 
 
406 aa  50.8  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  23.28 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  19.95 
 
 
409 aa  50.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 
421 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0753  major facilitator superfamily MFS_1  19.87 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  23.88 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  25.3 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
433 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  21.99 
 
 
416 aa  47  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0163  major facilitator transporter  20.78 
 
 
416 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  24.15 
 
 
432 aa  47.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  22.02 
 
 
471 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.71 
 
 
390 aa  46.6  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.71 
 
 
390 aa  46.6  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  23.73 
 
 
395 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0947  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
462 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000410718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  23.9 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  25 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  27.23 
 
 
397 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  23.9 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  23.9 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  23.42 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 
422 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  23.9 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2978  hypothetical protein  32.14 
 
 
96 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455586  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
415 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  27.67 
 
 
407 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 
423 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  28.39 
 
 
460 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
464 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 
383 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 
445 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  30.3 
 
 
387 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>