More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0479 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  100 
 
 		 223 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  92.83 
 
 		 225 aa  440  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  84.3 
 
 		 224 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  80.72 
 
 		 225 aa  397  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  82.06 
 
 		 224 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  78.44 
 
 		 221 aa  366  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  71.29 
 
 		 215 aa  330  8e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  66.82 
 
 		 220 aa  313  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  65.73 
 
 		 216 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  63.21 
 
 		 213 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  63.55 
 
 		 215 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  63.98 
 
 		 213 aa  294  6e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  59.81 
 
 		 215 aa  291  4e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  61.9 
 
 		 212 aa  291  6e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  59.35 
 
 		 215 aa  290  9e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  62.09 
 
 		 212 aa  284  7e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  59.63 
 
 		 221 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.5 
 
 		 225 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  58.37 
 
 		 223 aa  277  9e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.88 
 
 		 220 aa  270  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  57.33 
 
 		 226 aa  269  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  57.41 
 
 		 213 aa  264  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  52.29 
 
 		 225 aa  263  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  56.54 
 
 		 215 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.75 
 
 		 216 aa  261  4e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  55.76 
 
 		 217 aa  251  7e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  56.22 
 
 		 217 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.3 
 
 		 224 aa  248  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  55.3 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  55.3 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  54.63 
 
 		 217 aa  245  4e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.46 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  50.24 
 
 		 230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  49.53 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.39 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  46.85 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  47.39 
 
 		 213 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  47.87 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  49.06 
 
 		 213 aa  198  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  46.92 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  47.17 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  46.48 
 
 		 214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  47.17 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  43.89 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  46.98 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  45.25 
 
 		 240 aa  191  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  44.75 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  42.53 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  41.63 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  44.65 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  44.86 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.29 
 
 		 213 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  40.38 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  45.03 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  48.81 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  46.6 
 
 		 208 aa  161  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  45.03 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  39.6 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  44.44 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  44.5 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  41.36 
 
 		 211 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  41.36 
 
 		 211 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  42.35 
 
 		 212 aa  154  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  39.19 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  43.15 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  41.86 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  43.15 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  44.5 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  39.91 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.46 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  40.93 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  43.46 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  42.71 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  40.2 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  35.89 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  43.46 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  43.46 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  43.46 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  37.88 
 
 		 261 aa  149  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.41 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  42.41 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  42.41 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  44.91 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  42.93 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.41 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.1 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  42.41 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.41 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.41 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  42.41 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  41.84 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.51 
 
 		 212 aa  149  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  44.91 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  40.91 
 
 		 213 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  42.86 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  43.46 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  40.91 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  42.93 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  43.65 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  42.35 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>