More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0164 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  100 
 
 		 273 aa  569  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  66.54 
 
 		 273 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  59.63 
 
 		 273 aa  316  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  58.56 
 
 		 271 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  58.27 
 
 		 276 aa  301  5.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1659  ribonuclease III  62.17 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0172  Ribonuclease III  52.33 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  46.41 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  44.04 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  42.59 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  41.59 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  40.47 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4194  ribonuclease III  39.74 
 
 		 242 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197328  normal  0.7656 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  40.19 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  41.46 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  37.79 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  35.11 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  39.42 
 
 		 228 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  36.93 
 
 		 242 aa  148  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  36.79 
 
 		 232 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  37.73 
 
 		 236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  39.41 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  39.81 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  39.81 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  40.98 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  39.8 
 
 		 383 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  39.8 
 
 		 383 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  37.02 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  40.31 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  37.02 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  37.61 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  37.5 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  36.52 
 
 		 377 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  38.89 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  36.75 
 
 		 230 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  40.64 
 
 		 229 aa  142  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  39.9 
 
 		 229 aa  142  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  39.6 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  36.36 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  38.83 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  37.56 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  37.98 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  37.68 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  40.2 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  35.55 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  36.06 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  38.1 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  38.1 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5150  ribonuclease III  35.75 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0990083  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  37.44 
 
 		 222 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  36.92 
 
 		 248 aa  138  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  35.61 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  37.62 
 
 		 223 aa  138  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  36.82 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  37.44 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  37.44 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  38.39 
 
 		 239 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  39.53 
 
 		 230 aa  136  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  36.97 
 
 		 225 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  37.91 
 
 		 227 aa  136  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  38.6 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  37.12 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  38.92 
 
 		 223 aa  136  5e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  40.5 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  36.87 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  36.15 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  36.98 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  37.38 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  36.54 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  38.74 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  39.05 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  36.02 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  36.7 
 
 		 241 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  39.61 
 
 		 225 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  37.68 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  37.07 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1396  ribonuclease III  33.91 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  39.91 
 
 		 222 aa  132  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  33.62 
 
 		 246 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  33.93 
 
 		 240 aa  132  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  37.31 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  36.24 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  38.76 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3916  ribonuclease III  33.33 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  37.56 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  38.76 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  37.44 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  38.05 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  38.76 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  38.76 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  37.74 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  38.76 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  36 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  34.08 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  37.88 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  37.71 
 
 		 225 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  38.83 
 
 		 233 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  38.28 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  36.93 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  37.44 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>