217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3369 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3369  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
436 aa  820    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  33.73 
 
 
413 aa  153  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1460  major facilitator transporter  32.38 
 
 
393 aa  141  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1083  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 
400 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  27.51 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  26.17 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
383 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  25.74 
 
 
397 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
369 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
389 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
389 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
378 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  33.16 
 
 
396 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  26.99 
 
 
383 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  27.27 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  25.37 
 
 
403 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  26.13 
 
 
384 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
398 aa  97.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  31.22 
 
 
403 aa  96.7  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
377 aa  96.7  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  26.99 
 
 
383 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  26 
 
 
396 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  39.86 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
392 aa  95.5  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
397 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  26.63 
 
 
386 aa  94.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 
396 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  26.67 
 
 
393 aa  93.2  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  22.43 
 
 
386 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  29.3 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  28.11 
 
 
398 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  22.62 
 
 
385 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 
386 aa  90.5  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  37.43 
 
 
392 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 
408 aa  89.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  26.92 
 
 
384 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  26.92 
 
 
384 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  26.92 
 
 
384 aa  88.2  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  26.24 
 
 
408 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
405 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  24.94 
 
 
409 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  27.8 
 
 
419 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  36.72 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  30.69 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  31.36 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  39.33 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  29.16 
 
 
447 aa  80.1  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  38.19 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  28.09 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  31.91 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  31.91 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 
387 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0218  major facilitator transporter  33.51 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.851402  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  36.92 
 
 
373 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  24.52 
 
 
377 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8344  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2631  twin-arginine translocation pathway signal  36.76 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.774949  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  29.78 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  30.32 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  36.05 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  34.91 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  27.38 
 
 
393 aa  77  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 
381 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  27.52 
 
 
384 aa  76.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.95 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.95 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  25.13 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.95 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.95 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.95 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.95 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.95 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.75 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  33.11 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  27.01 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  20.2 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2704  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  26.65 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  20.35 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  37.93 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  23.33 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  21.75 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  29.65 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  32.24 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>