248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2154 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2154  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 287 aa  556  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2627  hypothetical protein  49.47 
 
 		 290 aa  255  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2360  ApbE family lipoprotein  51.06 
 
 		 290 aa  245  6.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000706086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1291  ApbE family lipoprotein  48.78 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.710022  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1526  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  40.89 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0153  thiamine biosynthesis lipoprotein, ApbE family  29.56 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.191913 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  36.64 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.59 
 
 		 350 aa  85.5  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.39 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  35.76 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  30.83 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.83 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  25.3 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  30.43 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  28.79 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  27.03 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  22.9 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  34.91 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  32.35 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.19 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  29.84 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  34.86 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  27.05 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  27.08 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  30.24 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  24.7 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  30.35 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.9 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  30.54 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  31.75 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  24.52 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  26.61 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  34.07 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  30.74 
 
 		 340 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.94 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  39.34 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  24.9 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  26.01 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  31.65 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  33.2 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  27.37 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  26.07 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  38.73 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  28.98 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.17 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  27.8 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  24.73 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  28.95 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  28.95 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  31 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  22.84 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  24.23 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  23.48 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  29.8 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  31.4 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  31.84 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6589  ApbE family lipoprotein  28.94 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  30.3 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  25.32 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  24.22 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0427  ApbE family lipoprotein  28.85 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127952  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.93 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  25.71 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  35.29 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.84 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  26.07 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  30.65 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  30.65 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  30.13 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  31.76 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.36 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  23.2 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  21.25 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  33.08 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.88 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  29.92 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  23.44 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  21.97 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  37.88 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  27.78 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.69 
 
 		 367 aa  58.9  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  25.38 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.28 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.51 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.51 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  27.04 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.45 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  29.39 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  22.17 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0038  ApbE family lipoprotein  30.13 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  29.61 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.86 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  23.18 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  23.18 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.86 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.18 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  21.15 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>