More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0123 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  53.45 
 
 
631 aa  675    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  53.29 
 
 
631 aa  669    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  53.45 
 
 
631 aa  671    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  52.66 
 
 
631 aa  664    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  53.29 
 
 
631 aa  667    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  53.45 
 
 
631 aa  672    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  53.45 
 
 
631 aa  672    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  53.76 
 
 
631 aa  677    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  56.74 
 
 
639 aa  752    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  50.46 
 
 
613 aa  640    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  53.29 
 
 
631 aa  667    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  53.92 
 
 
630 aa  674    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  100 
 
 
643 aa  1302    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  57.23 
 
 
642 aa  740    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  56.77 
 
 
642 aa  738    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  53.61 
 
 
631 aa  674    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  58.28 
 
 
653 aa  765    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  50 
 
 
631 aa  621  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  48.42 
 
 
629 aa  610  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  46.56 
 
 
642 aa  605  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  46.9 
 
 
642 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  47.21 
 
 
642 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  48.04 
 
 
632 aa  585  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  47.06 
 
 
646 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  46.73 
 
 
632 aa  581  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  46.33 
 
 
629 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  46.3 
 
 
630 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  47.59 
 
 
630 aa  567  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  46.21 
 
 
626 aa  567  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  46.39 
 
 
631 aa  558  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  45.85 
 
 
640 aa  558  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  45.95 
 
 
641 aa  545  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  43.53 
 
 
636 aa  546  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 
623 aa  542  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  44.38 
 
 
622 aa  544  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  43.59 
 
 
621 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  46.45 
 
 
630 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  45.41 
 
 
630 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  43.38 
 
 
641 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  42.9 
 
 
641 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  42.18 
 
 
620 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  43.21 
 
 
620 aa  517  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 
622 aa  514  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  43.82 
 
 
625 aa  514  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  42.81 
 
 
633 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 
652 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 
627 aa  500  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  40.91 
 
 
625 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  40.91 
 
 
625 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  41.81 
 
 
634 aa  502  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  43.26 
 
 
626 aa  499  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  41.46 
 
 
631 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  41.97 
 
 
644 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
622 aa  481  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  44.01 
 
 
623 aa  462  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  37.54 
 
 
636 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  37.81 
 
 
633 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.86 
 
 
556 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  39.63 
 
 
723 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  37.06 
 
 
634 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  37.99 
 
 
663 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  38.15 
 
 
636 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  36.07 
 
 
649 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  36.94 
 
 
642 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 
551 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  35.76 
 
 
649 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.6 
 
 
564 aa  403  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.95 
 
 
551 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  36.94 
 
 
632 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.95 
 
 
551 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 
559 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 
558 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 
555 aa  403  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.76 
 
 
558 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.38 
 
 
551 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  36.36 
 
 
649 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  36.17 
 
 
688 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  35.45 
 
 
654 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  36.04 
 
 
656 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  35.91 
 
 
649 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 
551 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.15 
 
 
551 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
555 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  35.76 
 
 
661 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.38 
 
 
561 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  35.76 
 
 
661 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  37.66 
 
 
596 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  38.53 
 
 
631 aa  398  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 
563 aa  398  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.38 
 
 
561 aa  399  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  34.76 
 
 
626 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  35.38 
 
 
641 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  35.3 
 
 
592 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 
670 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 
555 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  41.14 
 
 
554 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  36.07 
 
 
608 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0493  ABC transporter related protein  38.42 
 
 
602 aa  395  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 
648 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  40.95 
 
 
554 aa  395  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>