More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5275 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



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Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5275  ROK family protein  100 
 
 
297 aa  577  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244347 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0234  ROK family protein  36.75 
 
 
293 aa  189  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3301  ROK family protein  37.09 
 
 
290 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3152  ROK family protein  37.72 
 
 
291 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1578  ROK family protein  32.87 
 
 
292 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  34.74 
 
 
287 aa  168  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0111  ROK family protein  39.93 
 
 
299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.891557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2639  fructokinase  39.86 
 
 
296 aa  162  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0164  ROK family protein  36.27 
 
 
301 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1885  fructokinase  40.14 
 
 
301 aa  159  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00853813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0965  ROK family protein  43 
 
 
301 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3416  ROK family protein  39.65 
 
 
299 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0682932 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1709  fructokinase  34.53 
 
 
297 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1151  ROK family protein  41.49 
 
 
299 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.602337 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1689  fructokinase  32.16 
 
 
293 aa  149  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1584  fructokinase  34.78 
 
 
291 aa  145  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  32.17 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1708  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  32.01 
 
 
291 aa  142  8e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0014  transcriptional regulator and fructokinase  32.13 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000579085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3962  fructokinase  33.22 
 
 
296 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.177192 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32817  predicted protein  30.91 
 
 
347 aa  99  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  32.34 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  29.1 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  29.57 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  30.23 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  28.16 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  28.16 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  34.34 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  32.18 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  29.78 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  25.68 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  25.68 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  30.11 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  29.94 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  28.7 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  27.99 
 
 
318 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  31.29 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.87 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  32.23 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  32.18 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  47.31 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  29.28 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  30.31 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  31.14 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  31.29 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  30.96 
 
 
389 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  32.43 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  27.88 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  27.86 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  30.63 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  37.5 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  36.73 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  28.92 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  30.16 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  32.69 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.86 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  31.12 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  29.09 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  30.77 
 
 
387 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  22.58 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  30.25 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  33.94 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  30.18 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  34.17 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  29.66 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  36.43 
 
 
389 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  30.1 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  32.14 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  26.64 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  26.61 
 
 
321 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  30.98 
 
 
764 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  30.73 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  30.16 
 
 
363 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  30.41 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  24.24 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  30.29 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1072  ROK family protein  24.72 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  46.48 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0562  ROK family protein  26.23 
 
 
312 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  32.66 
 
 
390 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  22.31 
 
 
313 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  28.43 
 
 
314 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.97 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  29.3 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  28.31 
 
 
391 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  28.89 
 
 
299 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  29.93 
 
 
321 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  24.39 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  29.74 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  29.1 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  35.25 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  23.33 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  31.35 
 
 
323 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  28.52 
 
 
410 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  24.48 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  31.82 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.400197 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  31.88 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
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NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  33.74 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
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NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  33.5 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
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