More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0861 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0861  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
384 aa  773    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339041  normal  0.260174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
1465 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 
1146 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
678 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
1021 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  38.56 
 
 
433 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
713 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  37.5 
 
 
730 aa  192  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  37.38 
 
 
371 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 
919 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
683 aa  190  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
553 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
589 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
594 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 
392 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  40.78 
 
 
408 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  40.78 
 
 
408 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 
611 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  42.65 
 
 
611 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 
611 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  40.39 
 
 
524 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  41.64 
 
 
406 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
602 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  34.46 
 
 
724 aa  186  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3259  sensor histidine kinase  34.84 
 
 
598 aa  186  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
679 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  36.17 
 
 
770 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  38.13 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  34.52 
 
 
1850 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  33.65 
 
 
439 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  36.39 
 
 
429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  36.24 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
389 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  37.77 
 
 
389 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  37.77 
 
 
389 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  37.77 
 
 
389 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  37.77 
 
 
358 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  37.77 
 
 
389 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  37.77 
 
 
358 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  38.46 
 
 
305 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  35.35 
 
 
785 aa  177  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
468 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  31.55 
 
 
681 aa  176  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  32 
 
 
1187 aa  176  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
467 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
440 aa  176  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  35.37 
 
 
468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
785 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
443 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  34.54 
 
 
726 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
585 aa  173  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  38.3 
 
 
626 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  35.12 
 
 
457 aa  173  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  39.22 
 
 
627 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  39.22 
 
 
627 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  39.22 
 
 
627 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  39.22 
 
 
627 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  39.22 
 
 
627 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5447  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
448 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.151261 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  39.22 
 
 
627 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  32.65 
 
 
715 aa  172  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
492 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  39.22 
 
 
627 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  38.3 
 
 
505 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  36.82 
 
 
310 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
641 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
680 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
971 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
537 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
470 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
467 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.08 
 
 
1901 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
494 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
928 aa  169  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
557 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
715 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  33 
 
 
708 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
683 aa  169  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
445 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0967  sensor histidine kinase  38.43 
 
 
401 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
1036 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
407 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
1072 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
594 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
681 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.55 
 
 
1808 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  34.3 
 
 
458 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
685 aa  164  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 
571 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3608  sensor histidine kinase  35.27 
 
 
313 aa  163  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
566 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
688 aa  162  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.55 
 
 
1780 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
437 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.66 
 
 
1795 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  38.49 
 
 
912 aa  159  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
440 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
488 aa  159  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
675 aa  158  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>