95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1004 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  204  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  89.58 
 
 		 96 aa  184  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  87.5 
 
 		 96 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  86.46 
 
 		 96 aa  178  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  67.71 
 
 		 96 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  61.46 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  62.5 
 
 		 95 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  60.42 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  62.11 
 
 		 95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  59.38 
 
 		 96 aa  127  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  59.38 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  59.38 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  59.38 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  56.25 
 
 		 96 aa  124  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  56.25 
 
 		 96 aa  120  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  55.21 
 
 		 99 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  54.17 
 
 		 99 aa  118  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31570  CRISPR-associated protein Cas2  64.58 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1728  CRISPR-associated Cas2 family protein  56.25 
 
 		 96 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  52.08 
 
 		 99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  59.38 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  51.04 
 
 		 96 aa  107  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  52.58 
 
 		 97 aa  104  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.96 
 
 		 96 aa  98.2  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.96 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  47.87 
 
 		 99 aa  94.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  44.79 
 
 		 96 aa  94  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  46.81 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2357  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.81 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  41.67 
 
 		 96 aa  90.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  45.74 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  56.63 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  50.52 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  41.57 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  44.05 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  40.45 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  49.28 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.83 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.48 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  36.08 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.1 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  32.63 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  35.63 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  35.63 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.26 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  31.58 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  30.53 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.71 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  32.99 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2991  hypothetical protein  51.11 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  30.21 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  30.95 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.58 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  35.23 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.73 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  35.38 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.09 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.62 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  31.82 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  41.43 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  36.36 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  34.48 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  37.63 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.79 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  32.58 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.87 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  33.85 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  32.58 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  34.85 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.23 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.78 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  32.61 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.77 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.21 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  34.92 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.09 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  34.92 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  36.23 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.68 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.76 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.12 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  31.87 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.91 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.88 
 
 		 87 aa  42.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.25 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  34.25 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  31.88 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  34.92 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.78 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  31.58 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  33.8 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  42.03 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.42 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>