More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7703 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  538  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  69.35 
 
 		 267 aa  360  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  68.98 
 
 		 263 aa  352  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  63.5 
 
 		 260 aa  344  8.999999999999999e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  66.13 
 
 		 260 aa  343  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  65.74 
 
 		 258 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  65.2 
 
 		 273 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  63.89 
 
 		 254 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  64.52 
 
 		 250 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  64.11 
 
 		 250 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  66.67 
 
 		 252 aa  331  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  63.1 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  64.52 
 
 		 256 aa  329  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  64.45 
 
 		 254 aa  325  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  63.1 
 
 		 254 aa  322  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  62.5 
 
 		 267 aa  321  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  62.4 
 
 		 254 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  63.1 
 
 		 255 aa  319  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  65.04 
 
 		 254 aa  318  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  63.37 
 
 		 259 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  61.85 
 
 		 256 aa  315  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  61.69 
 
 		 263 aa  313  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  60 
 
 		 253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  60.7 
 
 		 274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.32 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  61.45 
 
 		 279 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  62.55 
 
 		 256 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  60.56 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  63.11 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  60.4 
 
 		 254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  59.51 
 
 		 259 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  60.98 
 
 		 254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  59.84 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  61.85 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.32 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  59.84 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  60.33 
 
 		 256 aa  302  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.2 
 
 		 595 aa  301  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  62.55 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.92 
 
 		 597 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  58.08 
 
 		 262 aa  298  5e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  59.38 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  57.43 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  56.92 
 
 		 597 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.92 
 
 		 597 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.66 
 
 		 592 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  61.26 
 
 		 262 aa  295  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  59.84 
 
 		 244 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.8 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.26 
 
 		 594 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.26 
 
 		 594 aa  292  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  57.25 
 
 		 619 aa  291  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  59.27 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  60.71 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  57.09 
 
 		 602 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 		 268 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1137  ABC transporter related  60.41 
 
 		 254 aa  289  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4597  putative ATP-binding component of ABC transporter  59.27 
 
 		 265 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.838363  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.29 
 
 		 299 aa  288  6e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  58.06 
 
 		 243 aa  288  9e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  58 
 
 		 598 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.27 
 
 		 278 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  56.85 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.1 
 
 		 276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  60.96 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  56.05 
 
 		 272 aa  285  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  57.38 
 
 		 255 aa  285  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  59.68 
 
 		 257 aa  285  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.85 
 
 		 595 aa  285  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.52 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  57.66 
 
 		 252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  58.47 
 
 		 240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.85 
 
 		 240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  54.89 
 
 		 272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  55.17 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  57.54 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  57.43 
 
 		 267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  58.06 
 
 		 263 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  58.1 
 
 		 263 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  57.96 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  57.96 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  59.68 
 
 		 243 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  54.41 
 
 		 636 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  54.41 
 
 		 636 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  54.41 
 
 		 636 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  54.41 
 
 		 636 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 273 aa  280  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.41 
 
 		 636 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  58.02 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  54.41 
 
 		 636 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.45 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  57.03 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  58.47 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.05 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  57.69 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  62.24 
 
 		 267 aa  279  3e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  54.86 
 
 		 274 aa  278  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  54.02 
 
 		 636 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.66 
 
 		 242 aa  278  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>