More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6092 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  100 
 
 		 419 aa  850    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  44.91 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  43.89 
 
 		 416 aa  286  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3080  beta-lactamase  39.42 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  30.56 
 
 		 361 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  33.84 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.33 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.33 
 
 		 392 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  30.33 
 
 		 578 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  32.46 
 
 		 445 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.53 
 
 		 487 aa  142  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  35.2 
 
 		 363 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  31.27 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  31.64 
 
 		 341 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  31.18 
 
 		 343 aa  132  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  30.07 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  30.07 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  29.71 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.71 
 
 		 421 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  31.27 
 
 		 510 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  29.71 
 
 		 415 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.35 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  34.91 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  29.72 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  29.56 
 
 		 416 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  29.35 
 
 		 413 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  30.04 
 
 		 413 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  32.63 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  28.99 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  30.26 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.78 
 
 		 446 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  29.45 
 
 		 340 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  29.45 
 
 		 340 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  29.09 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  29.45 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  27.3 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  27.15 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  29.43 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.57 
 
 		 446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  32.09 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.23 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.82 
 
 		 366 aa  116  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  30.03 
 
 		 848 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  29.53 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.92 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  38.95 
 
 		 470 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.73 
 
 		 543 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.73 
 
 		 543 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  29.06 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  29.06 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  25.85 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  29.52 
 
 		 410 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0502  beta-lactamase  31.61 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  28.63 
 
 		 378 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  30.12 
 
 		 364 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  31.1 
 
 		 356 aa  109  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  25.62 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  29.75 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  27.94 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  33.51 
 
 		 603 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  34.04 
 
 		 593 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  26.77 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  33.33 
 
 		 364 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  26.42 
 
 		 537 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  34.03 
 
 		 601 aa  106  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  30.98 
 
 		 376 aa  106  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  29.89 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  30.62 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  29.84 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  28.06 
 
 		 371 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  33.16 
 
 		 611 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  30.62 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  29.89 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  30.62 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  30.62 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  30.65 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.3 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  26.56 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  30.82 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  32.11 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.05 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.16 
 
 		 362 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  29.07 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  25.87 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  31.07 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  30.65 
 
 		 713 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  28.43 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.81 
 
 		 477 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  30.08 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  31.85 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  34.09 
 
 		 330 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  32.55 
 
 		 466 aa  99.8  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.23 
 
 		 582 aa  99.8  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  29.74 
 
 		 420 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  29.43 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  28.68 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  26.59 
 
 		 662 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  26.79 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  29.67 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.25 
 
 		 834 aa  99.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>