More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5718 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  62.52 
 
 		 602 aa  699    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  56.51 
 
 		 671 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  62.37 
 
 		 613 aa  698    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  100 
 
 		 589 aa  1152    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  61.22 
 
 		 608 aa  660    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  57.02 
 
 		 597 aa  629  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  50.73 
 
 		 726 aa  594  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  55.19 
 
 		 591 aa  581  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  55.77 
 
 		 625 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  54.65 
 
 		 638 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  53.22 
 
 		 625 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  51.22 
 
 		 609 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  50.43 
 
 		 610 aa  544  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.57 
 
 		 617 aa  521  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.24 
 
 		 606 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  51.36 
 
 		 635 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 605 aa  478  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  47.79 
 
 		 608 aa  464  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  45.9 
 
 		 730 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  41.44 
 
 		 584 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  42.15 
 
 		 984 aa  316  6e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  37.75 
 
 		 1522 aa  286  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  30.12 
 
 		 594 aa  276  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  38.93 
 
 		 1284 aa  276  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  29.62 
 
 		 585 aa  276  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.85 
 
 		 581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  29.36 
 
 		 593 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.06 
 
 		 1257 aa  266  8e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  29.8 
 
 		 582 aa  264  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.53 
 
 		 575 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  34.93 
 
 		 631 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  31.99 
 
 		 577 aa  259  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  29.76 
 
 		 593 aa  259  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  29.22 
 
 		 588 aa  258  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.98 
 
 		 571 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  36.78 
 
 		 640 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  33.77 
 
 		 588 aa  255  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  30.11 
 
 		 586 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  29.6 
 
 		 598 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  33.96 
 
 		 581 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  31.41 
 
 		 577 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.11 
 
 		 578 aa  254  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.11 
 
 		 578 aa  254  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  36.04 
 
 		 628 aa  253  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  30.16 
 
 		 586 aa  253  6e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  31.6 
 
 		 577 aa  253  6e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  29.31 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.35 
 
 		 606 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.39 
 
 		 571 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  34.43 
 
 		 589 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  37.11 
 
 		 1321 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  31.21 
 
 		 604 aa  252  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.86 
 
 		 567 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  27.93 
 
 		 596 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.57 
 
 		 571 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.57 
 
 		 571 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.57 
 
 		 571 aa  251  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.57 
 
 		 571 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.57 
 
 		 571 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.57 
 
 		 571 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.54 
 
 		 567 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  28.02 
 
 		 606 aa  250  5e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.6 
 
 		 567 aa  250  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.57 
 
 		 571 aa  249  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  39.52 
 
 		 1231 aa  249  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  33.27 
 
 		 583 aa  247  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 		 578 aa  246  6e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  31.37 
 
 		 590 aa  246  6e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  34.29 
 
 		 641 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.36 
 
 		 571 aa  246  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  29.08 
 
 		 581 aa  246  8e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  33.33 
 
 		 606 aa  246  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.94 
 
 		 555 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  29.17 
 
 		 581 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  31.25 
 
 		 604 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  32.8 
 
 		 580 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.27 
 
 		 601 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  28.95 
 
 		 578 aa  244  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  34.93 
 
 		 640 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  33.78 
 
 		 641 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  34.5 
 
 		 652 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  29.79 
 
 		 588 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  34.14 
 
 		 650 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  34.14 
 
 		 650 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.33 
 
 		 622 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.18 
 
 		 577 aa  242  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  33.52 
 
 		 633 aa  243  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  30.96 
 
 		 591 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.83 
 
 		 636 aa  242  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  34.08 
 
 		 1264 aa  242  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  32.67 
 
 		 541 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.86 
 
 		 616 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  31.76 
 
 		 578 aa  240  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  29.64 
 
 		 572 aa  240  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  33.74 
 
 		 625 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  28.77 
 
 		 588 aa  239  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.57 
 
 		 589 aa  239  9e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  32.64 
 
 		 584 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  35.94 
 
 		 577 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  28.8 
 
 		 585 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>