143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3202 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 588 aa  1109    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  35.8 
 
 		 560 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  38.46 
 
 		 564 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 565 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  34.8 
 
 		 578 aa  87  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  38.61 
 
 		 551 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  36.58 
 
 		 559 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  30.62 
 
 		 649 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  34.59 
 
 		 869 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  41.13 
 
 		 607 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  35.42 
 
 		 577 aa  68.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  31.61 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  29.65 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  34.75 
 
 		 605 aa  65.1  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  41.28 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  33.33 
 
 		 188 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  40.57 
 
 		 244 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  41.28 
 
 		 208 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  34.29 
 
 		 692 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  40.34 
 
 		 207 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  33.88 
 
 		 687 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 128 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 128 aa  62  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  26.11 
 
 		 547 aa  62  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 128 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  26.5 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  22.67 
 
 		 544 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.95 
 
 		 613 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 173 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  35.48 
 
 		 126 aa  59.7  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  23.03 
 
 		 544 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  29.59 
 
 		 173 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  22.09 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  22.09 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  36.23 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  24.6 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  25.36 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  22.47 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  30.84 
 
 		 571 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  29.59 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  39.25 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  22.09 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  37.62 
 
 		 119 aa  57  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  36.08 
 
 		 681 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  29.63 
 
 		 210 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  32.47 
 
 		 686 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.19 
 
 		 731 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  36.13 
 
 		 118 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  39 
 
 		 339 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  37.27 
 
 		 722 aa  56.2  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  37.89 
 
 		 664 aa  55.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  33.13 
 
 		 513 aa  55.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  33.63 
 
 		 125 aa  55.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  36.18 
 
 		 642 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  37.4 
 
 		 576 aa  55.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  31.31 
 
 		 124 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  31.31 
 
 		 124 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  31.31 
 
 		 124 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  37.39 
 
 		 309 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  31.31 
 
 		 124 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 127 aa  54.7  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  31.31 
 
 		 124 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  31.31 
 
 		 124 aa  54.7  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 184 aa  54.3  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  30.3 
 
 		 124 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  31.31 
 
 		 124 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  39.6 
 
 		 284 aa  53.9  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  35.51 
 
 		 593 aa  53.9  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  34.58 
 
 		 314 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  27.33 
 
 		 172 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  34.58 
 
 		 314 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  34.75 
 
 		 288 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  30.83 
 
 		 197 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  34.82 
 
 		 310 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  35.43 
 
 		 172 aa  52.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  34.35 
 
 		 651 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  28.12 
 
 		 590 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  31.31 
 
 		 124 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  31.67 
 
 		 124 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  33.57 
 
 		 697 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  26.64 
 
 		 702 aa  52  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  26.64 
 
 		 702 aa  52  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 		 174 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1603  copper resistance protein CopC  27.4 
 
 		 145 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.561066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  34.44 
 
 		 651 aa  52  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  32.73 
 
 		 174 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  32.73 
 
 		 174 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  37.63 
 
 		 679 aa  51.6  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  27.06 
 
 		 718 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  28.45 
 
 		 124 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  32.67 
 
 		 678 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 528 aa  50.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  28.48 
 
 		 295 aa  50.8  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1741  copper resistance D  33.55 
 
 		 550 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  33.33 
 
 		 512 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  33.59 
 
 		 539 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  31.65 
 
 		 400 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  33.33 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  35.64 
 
 		 180 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  37.61 
 
 		 719 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>