247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1912 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1912  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 664 aa  1330    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8771  cell envelope-related transcriptional attenuator  61.56 
 
 		 547 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1296  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.36 
 
 		 414 aa  286  8e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13519  hypothetical protein  42.15 
 
 		 512 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.98 
 
 		 732 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  39.08 
 
 		 522 aa  253  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7119  cell envelope-related transcriptional attenuator  50.16 
 
 		 382 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.54 
 
 		 517 aa  217  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.37 
 
 		 538 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.68 
 
 		 493 aa  206  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  38 
 
 		 496 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.87 
 
 		 493 aa  200  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1299  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.92 
 
 		 340 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  34.36 
 
 		 497 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.02 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.46 
 
 		 567 aa  194  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.71 
 
 		 490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.71 
 
 		 490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.71 
 
 		 490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06070  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.98 
 
 		 514 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.974325  normal  0.0563121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.34 
 
 		 521 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  32.45 
 
 		 676 aa  150  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.62 
 
 		 491 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  26.33 
 
 		 734 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.13 
 
 		 468 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.59 
 
 		 497 aa  114  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  26.9 
 
 		 505 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.05 
 
 		 504 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.63 
 
 		 414 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.83 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.42 
 
 		 699 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.42 
 
 		 699 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.42 
 
 		 701 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.66 
 
 		 336 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.95 
 
 		 512 aa  106  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  28.81 
 
 		 420 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  26.09 
 
 		 530 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.95 
 
 		 521 aa  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.86 
 
 		 625 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.22 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.11 
 
 		 649 aa  100  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.96 
 
 		 468 aa  100  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.78 
 
 		 618 aa  100  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.55 
 
 		 379 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.91 
 
 		 687 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  29.03 
 
 		 481 aa  97.8  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.55 
 
 		 560 aa  97.4  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.47 
 
 		 549 aa  97.8  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.59 
 
 		 486 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.9 
 
 		 520 aa  96.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.25 
 
 		 406 aa  95.5  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.55 
 
 		 481 aa  94.7  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.04 
 
 		 478 aa  94.7  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.55 
 
 		 573 aa  93.6  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  31.87 
 
 		 395 aa  93.2  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.38 
 
 		 400 aa  93.2  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.82 
 
 		 320 aa  93.2  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  27.65 
 
 		 434 aa  92.8  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.07 
 
 		 404 aa  92.8  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.77 
 
 		 584 aa  92.8  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 489 aa  92  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.96 
 
 		 487 aa  91.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.8 
 
 		 453 aa  91.3  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.42 
 
 		 545 aa  91.3  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  26.74 
 
 		 684 aa  91.7  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.11 
 
 		 509 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3559  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.21 
 
 		 352 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.1 
 
 		 377 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.06 
 
 		 306 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.03 
 
 		 409 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.67 
 
 		 499 aa  88.6  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.36 
 
 		 540 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.75 
 
 		 506 aa  87  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.15 
 
 		 1336 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  29.82 
 
 		 326 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.69 
 
 		 643 aa  85.1  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.27 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.97 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  26.25 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.97 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.97 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.15 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0588  putative transcriptional regulator  27.69 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.952975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.33 
 
 		 407 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  25.79 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.73 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3959  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.55 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.39 
 
 		 520 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3034  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.21 
 
 		 379 aa  79.7  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.63975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  26.5 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.54 
 
 		 526 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  25.51 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.2 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  27.7 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.86 
 
 		 365 aa  77  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  25.44 
 
 		 365 aa  77  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.04 
 
 		 508 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.07 
 
 		 516 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.15 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  25.35 
 
 		 619 aa  75.5  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>