More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1895 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  100 
 
 		 343 aa  685    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  56.83 
 
 		 309 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  51.25 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  45.85 
 
 		 321 aa  235  9e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.32 
 
 		 310 aa  232  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  46.26 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.64 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  44.05 
 
 		 353 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  42.14 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  50.99 
 
 		 285 aa  192  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  41.05 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  33.12 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  49.3 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  49.48 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  42.35 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  52.6 
 
 		 282 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.45 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  38.6 
 
 		 310 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  50.75 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  38.91 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.16 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  36.74 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  48.96 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  39.65 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  50.5 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  34.31 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  35.78 
 
 		 388 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4839  ABC transporter related protein  49.1 
 
 		 314 aa  169  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  51 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  37.19 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  39.5 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  34.54 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  33.22 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  33.93 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 		 253 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  39.3 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  46.35 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 		 300 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.55 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  36.88 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  38.35 
 
 		 299 aa  162  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  47.12 
 
 		 284 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  44.06 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  45.64 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  36.56 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 		 300 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  36.04 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  43.5 
 
 		 374 aa  159  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  38.57 
 
 		 741 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  40.53 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  40.18 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3454  ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  45 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3150  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  38.3 
 
 		 253 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.962721  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  34.95 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 300 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  36.46 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  36 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3468  ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 253 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000910882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0702  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3240  ABC transporter ATP-binding protein  37.87 
 
 		 253 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  37.54 
 
 		 311 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3493  ABC transporter ATP-binding protein  37.87 
 
 		 253 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.644181  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 302 aa  155  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3213  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  37.87 
 
 		 253 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  39.02 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  33.94 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  33.22 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  39.49 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  39.66 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  31.27 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  36.14 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  48.89 
 
 		 294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  36.84 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3447  ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 253 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0135545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.99 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.3 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  38.83 
 
 		 275 aa  152  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  33.58 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 281 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  36.97 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>