More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1533 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 368 aa  692    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  53.23 
 
 		 276 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  49.48 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  53.16 
 
 		 348 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  48.11 
 
 		 289 aa  239  6.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  49.26 
 
 		 281 aa  238  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  49.64 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  49.08 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  49.44 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  50.94 
 
 		 441 aa  233  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  45.99 
 
 		 311 aa  229  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  44.73 
 
 		 284 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  47.94 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  49.1 
 
 		 308 aa  225  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  49.06 
 
 		 287 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  44.04 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  48.2 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  51.67 
 
 		 484 aa  219  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  47.57 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.82 
 
 		 403 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  47.3 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  41.89 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  40.43 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  47.35 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 		 284 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 		 284 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 		 284 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  43.34 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  39.3 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  38.33 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  43.37 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  42.7 
 
 		 296 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  44.14 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  40.07 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  40.88 
 
 		 278 aa  153  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  29.71 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  30.72 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  37.85 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  30.9 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  50.71 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  50.71 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  50.71 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  50.71 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  50.71 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  52.54 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  52.54 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  52.54 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  52.54 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  38.67 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  50.71 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  49.29 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  49.29 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.29 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  49.29 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  49.29 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  49.29 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  37.81 
 
 		 272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  49.29 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  49.29 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.26 
 
 		 475 aa  110  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  51.67 
 
 		 285 aa  109  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  36.6 
 
 		 287 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  38 
 
 		 265 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  30.57 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  30.5 
 
 		 275 aa  106  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  32.62 
 
 		 287 aa  106  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  46.61 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  32.41 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  46.32 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  53.64 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  40.65 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  40.79 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  34.22 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  34.22 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  44.9 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  49.58 
 
 		 285 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 		 279 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  49.58 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  46.55 
 
 		 265 aa  102  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  37.84 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  37.11 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  45.3 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  47.9 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  38.38 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  47.9 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  39.53 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  45.76 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  45.3 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  36.87 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  45.76 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  30.74 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  30.74 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  47.9 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  41.83 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>