284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2946 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2946  SNF2 family protein  100 
 
 		 1024 aa  2109    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2642  type III restriction enzyme, res subunit  26.98 
 
 		 1044 aa  218  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4392  helicase domain protein  31.25 
 
 		 1069 aa  162  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0282  Type III restriction enzyme, res subunit  27.48 
 
 		 1101 aa  142  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.395373  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  26.9 
 
 		 805 aa  105  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  23.28 
 
 		 960 aa  101  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  24.04 
 
 		 964 aa  95.1  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  23.61 
 
 		 971 aa  93.6  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  24.68 
 
 		 966 aa  93.6  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2218  ATP-dependent helicase HepA  25.9 
 
 		 958 aa  92  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  23.3 
 
 		 980 aa  90.5  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  22.09 
 
 		 942 aa  90.1  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  25.13 
 
 		 1170 aa  90.1  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2247  ATP-dependent helicase HepA  24.74 
 
 		 958 aa  89.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  23.62 
 
 		 968 aa  89  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  23.62 
 
 		 968 aa  89  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  23.43 
 
 		 968 aa  88.2  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  24.53 
 
 		 982 aa  86.7  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  21.84 
 
 		 1167 aa  86.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  22.42 
 
 		 967 aa  85.9  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  24.11 
 
 		 892 aa  85.1  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  28.11 
 
 		 940 aa  85.1  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2531  ATP-dependent helicase HepA  26.65 
 
 		 949 aa  84  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  23.51 
 
 		 898 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  24.92 
 
 		 898 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  30.93 
 
 		 346 aa  83.2  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  23.42 
 
 		 966 aa  82.4  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  21.1 
 
 		 966 aa  82  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  33.15 
 
 		 801 aa  82  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  22.67 
 
 		 962 aa  81.6  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0536  ATP-dependent helicase HepA  21.86 
 
 		 968 aa  82  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00420482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4527  helicase domain-containing protein  25.56 
 
 		 982 aa  81.6  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  23.1 
 
 		 952 aa  81.3  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  27.53 
 
 		 947 aa  80.5  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  22.62 
 
 		 942 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  23.24 
 
 		 829 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  22.88 
 
 		 905 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  25.07 
 
 		 968 aa  80.9  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  23.67 
 
 		 1172 aa  80.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  23.28 
 
 		 929 aa  80.1  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  31.07 
 
 		 578 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  22.4 
 
 		 1031 aa  79.7  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  29.29 
 
 		 922 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  24.16 
 
 		 967 aa  79.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  25.67 
 
 		 988 aa  79.3  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  25.82 
 
 		 957 aa  79  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  26.97 
 
 		 669 aa  78.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  31.82 
 
 		 555 aa  78.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  23.67 
 
 		 967 aa  78.6  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  28.5 
 
 		 967 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  22.96 
 
 		 969 aa  78.2  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  26.89 
 
 		 949 aa  77.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  24.54 
 
 		 933 aa  77.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  29.29 
 
 		 925 aa  76.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  26.15 
 
 		 1167 aa  76.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  25.47 
 
 		 1028 aa  77  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  26.2 
 
 		 943 aa  76.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  26.39 
 
 		 1170 aa  76.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  31.82 
 
 		 554 aa  76.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  27 
 
 		 941 aa  76.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  29.55 
 
 		 572 aa  76.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  25.94 
 
 		 948 aa  75.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  27 
 
 		 941 aa  76.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  23.47 
 
 		 969 aa  76.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  24.53 
 
 		 968 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  25.69 
 
 		 1167 aa  75.5  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  22.69 
 
 		 949 aa  75.1  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.44 
 
 		 961 aa  75.1  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  24.46 
 
 		 968 aa  75.1  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  28.64 
 
 		 968 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  28.64 
 
 		 968 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  25.46 
 
 		 946 aa  74.7  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  28.64 
 
 		 968 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  28.64 
 
 		 968 aa  74.7  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0832  DEAD-like helicases-like  27.5 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  28.64 
 
 		 968 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  28.64 
 
 		 968 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1144 aa  73.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  23.09 
 
 		 835 aa  73.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  24.73 
 
 		 1160 aa  74.3  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  24.07 
 
 		 1145 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  28.64 
 
 		 968 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  28.71 
 
 		 927 aa  73.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  28.16 
 
 		 968 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  29.63 
 
 		 584 aa  73.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  29.41 
 
 		 968 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  27.27 
 
 		 975 aa  73.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  26.15 
 
 		 967 aa  73.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  28.14 
 
 		 1169 aa  73.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  29.1 
 
 		 584 aa  73.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  30.68 
 
 		 560 aa  73.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  25.39 
 
 		 968 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  25.46 
 
 		 941 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  20.53 
 
 		 1045 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  26.18 
 
 		 970 aa  73.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  28.16 
 
 		 968 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  22.1 
 
 		 969 aa  72.8  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  27.89 
 
 		 1094 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  25.99 
 
 		 968 aa  72.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  25.99 
 
 		 968 aa  72.4  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>