More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0536 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1485  ATP-dependent helicase HepA  49.07 
 
 		 947 aa  891    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  56.49 
 
 		 968 aa  1141    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  57.63 
 
 		 968 aa  1170    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  57.63 
 
 		 968 aa  1170    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1145  ATP-dependent helicase HepA  49.38 
 
 		 948 aa  904    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.286627 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  57.79 
 
 		 969 aa  1182    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2531  ATP-dependent helicase HepA  46.99 
 
 		 949 aa  812    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  56.91 
 
 		 968 aa  1162    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  56.45 
 
 		 967 aa  1136    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  57.11 
 
 		 968 aa  1163    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3615  ATP-dependent helicase HepA  42.93 
 
 		 953 aa  753    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  52.14 
 
 		 975 aa  1023    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  85.95 
 
 		 968 aa  1731    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  85.85 
 
 		 968 aa  1738    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  57.63 
 
 		 968 aa  1169    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  49.27 
 
 		 948 aa  896    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  56.14 
 
 		 967 aa  1136    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  45.98 
 
 		 947 aa  842    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  82.32 
 
 		 968 aa  1663    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1162  ATP-dependent helicase HepA  49.69 
 
 		 948 aa  910    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504978  normal  0.026685 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2247  ATP-dependent helicase HepA  42.68 
 
 		 958 aa  804    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2218  ATP-dependent helicase HepA  42.79 
 
 		 958 aa  802    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3842  ATP-dependent helicase HepA  49.48 
 
 		 948 aa  902    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  41.09 
 
 		 982 aa  699    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  58.23 
 
 		 969 aa  1187    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4527  helicase domain-containing protein  40.36 
 
 		 982 aa  687    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1179  ATP-dependent helicase HepA  49.59 
 
 		 948 aa  909    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.572965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  56.19 
 
 		 968 aa  1139    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  57.59 
 
 		 967 aa  1152    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  57.11 
 
 		 968 aa  1163    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  55.93 
 
 		 967 aa  1127    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  85.74 
 
 		 968 aa  1735    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  56.68 
 
 		 919 aa  1088    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1255  ATP-dependent helicase HepA  49.9 
 
 		 948 aa  909    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  85.64 
 
 		 968 aa  1734    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  57.63 
 
 		 968 aa  1171    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  56.19 
 
 		 968 aa  1139    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  80.04 
 
 		 968 aa  1620    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0536  ATP-dependent helicase HepA  100 
 
 		 968 aa  1990    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00420482  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  43.64 
 
 		 980 aa  736    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  41.45 
 
 		 1028 aa  699    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  81.8 
 
 		 968 aa  1655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1812  ATP-dependent helicase HepA  49.95 
 
 		 948 aa  894    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.502146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  57.11 
 
 		 968 aa  1162    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  58.13 
 
 		 969 aa  1205    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0112  ATP-dependent helicase HepA  41.09 
 
 		 960 aa  638    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000140392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  48.34 
 
 		 943 aa  895    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  59.44 
 
 		 969 aa  1234    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  49.85 
 
 		 966 aa  942    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  85.74 
 
 		 968 aa  1730    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  85.74 
 
 		 968 aa  1729    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  80.35 
 
 		 968 aa  1610    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  87.81 
 
 		 968 aa  1775    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30280  ATP-dependent helicase HepA  49.53 
 
 		 949 aa  900    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  49.74 
 
 		 950 aa  895    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4272  ATP-dependent helicase HepA  49.48 
 
 		 948 aa  905    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  56.24 
 
 		 944 aa  1117    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  85.74 
 
 		 968 aa  1731    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  85.85 
 
 		 968 aa  1738    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  57.63 
 
 		 968 aa  1170    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  57.63 
 
 		 968 aa  1170    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  86.78 
 
 		 968 aa  1752    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  57.63 
 
 		 968 aa  1170    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  78.28 
 
 		 967 aa  1555    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  55.61 
 
 		 970 aa  1134    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  57.11 
 
 		 968 aa  1163    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  57.63 
 
 		 968 aa  1168    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  56.08 
 
 		 968 aa  1138    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  37.4 
 
 		 942 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1680  ATP-dependent helicase HepA  34.09 
 
 		 874 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0454688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  27.86 
 
 		 905 aa  207  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  27.79 
 
 		 892 aa  201  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  27.79 
 
 		 898 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  27.35 
 
 		 898 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.23 
 
 		 941 aa  156  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.23 
 
 		 941 aa  156  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  24.88 
 
 		 988 aa  154  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.39 
 
 		 933 aa  148  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  27.17 
 
 		 560 aa  146  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  28.31 
 
 		 584 aa  145  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  25.92 
 
 		 669 aa  144  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.61 
 
 		 555 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.78 
 
 		 584 aa  137  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  26.51 
 
 		 554 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  28.49 
 
 		 919 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  27.36 
 
 		 1167 aa  127  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  25.3 
 
 		 1138 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  27.02 
 
 		 973 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  27.67 
 
 		 1031 aa  120  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.78 
 
 		 1045 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  25.49 
 
 		 945 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.34 
 
 		 1028 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  27.17 
 
 		 1046 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  36.24 
 
 		 1094 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  25.53 
 
 		 952 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  38.46 
 
 		 1057 aa  114  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  25.53 
 
 		 952 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  33.02 
 
 		 1065 aa  114  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  33.02 
 
 		 1065 aa  114  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  25.69 
 
 		 952 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>