More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1882 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  63.93 
 
 		 842 aa  1061    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 854 aa  1751    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  72.72 
 
 		 854 aa  1252    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  47.85 
 
 		 868 aa  809    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  69.32 
 
 		 856 aa  1226    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  48.48 
 
 		 881 aa  812    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.1 
 
 		 645 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.62 
 
 		 635 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.44 
 
 		 655 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 1316 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 		 1140 aa  340  8e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 		 1146 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 1146 aa  337  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 		 1145 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  37.97 
 
 		 1146 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  37.07 
 
 		 1145 aa  336  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 1146 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 		 1146 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  42.86 
 
 		 1142 aa  335  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 		 1140 aa  334  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 1146 aa  333  8e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 		 1146 aa  333  8e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.66 
 
 		 1159 aa  333  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  42.63 
 
 		 1141 aa  330  7e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 		 1172 aa  323  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 		 567 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 		 554 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 744 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.85 
 
 		 556 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  36.02 
 
 		 1161 aa  313  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 		 574 aa  313  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 		 1140 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  36.41 
 
 		 1159 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  36.05 
 
 		 1159 aa  302  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  38.71 
 
 		 594 aa  297  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  37.56 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  39.31 
 
 		 1169 aa  294  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  39.86 
 
 		 1157 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 		 1159 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  38 
 
 		 487 aa  287  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1152 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 		 1159 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 1158 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.25 
 
 		 1158 aa  282  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 1169 aa  282  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 		 1156 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 		 1159 aa  281  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.69 
 
 		 1184 aa  278  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 1161 aa  273  9e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 		 1169 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 		 1169 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 1166 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 1138 aa  270  7e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  38.71 
 
 		 1148 aa  269  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 		 1168 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 1174 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 		 1168 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.19 
 
 		 1169 aa  263  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 1163 aa  262  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1170 aa  261  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 880 aa  261  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  31.05 
 
 		 1150 aa  261  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 		 1172 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  36.76 
 
 		 1055 aa  259  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 1167 aa  258  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  34.92 
 
 		 1174 aa  258  5e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 1152 aa  256  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  37.64 
 
 		 1147 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  35.78 
 
 		 1177 aa  256  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  35.43 
 
 		 881 aa  255  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  34.35 
 
 		 747 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 817 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  36.41 
 
 		 448 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 634 aa  251  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 545 aa  251  4e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.55 
 
 		 1185 aa  250  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 1177 aa  250  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1111 aa  250  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 		 1171 aa  250  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.63 
 
 		 1168 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.04 
 
 		 733 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 733 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 1169 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1145 aa  249  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 545 aa  248  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 883 aa  248  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  33.88 
 
 		 676 aa  247  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 		 733 aa  244  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 1172 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 662 aa  241  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1168 aa  241  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1175 aa  238  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  33.91 
 
 		 447 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 1168 aa  235  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  33.41 
 
 		 452 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.64 
 
 		 1179 aa  232  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  34.31 
 
 		 454 aa  231  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  34.31 
 
 		 447 aa  231  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1817  histidine kinase  34.64 
 
 		 454 aa  230  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.86 
 
 		 1156 aa  228  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>