More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1187 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  100 
 
 		 308 aa  642    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  34.78 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 		 291 aa  158  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 		 288 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 288 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  33.55 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  32.99 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  32.87 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  31.96 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  31.62 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  31.13 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  31.96 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  31.93 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  30.54 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  33.7 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  31.01 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  31.4 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  29.41 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  31.83 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  27.81 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  28.73 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  29.92 
 
 		 244 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  29.09 
 
 		 359 aa  99.8  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  26.86 
 
 		 308 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  25.58 
 
 		 2762 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 327 aa  85.9  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  25.5 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.4 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  34.44 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  25.61 
 
 		 3045 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  24.75 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  24.75 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  27.6 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  33.87 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  22.6 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  24.29 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  29.94 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  21.67 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1389  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.48672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  22.26 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  24.1 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  31.21 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  22.74 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  21.23 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.08 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>