More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0455 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  511  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  96.93 
 
 		 261 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  35.06 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 267 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 267 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 281 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  20.47 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  22.64 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 161 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  43 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  29.37 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  34.04 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  32.98 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 276 aa  72  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  19.28 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  27.76 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  34.04 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  27.76 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  26.87 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  34.4 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  38.32 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  34.02 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  22.27 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  32.98 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  43.75 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  35.04 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  35.64 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  29.91 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  35 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  34.75 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  39.78 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  33.05 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  35.77 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  43.62 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  39.13 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  34.65 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  40.58 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  40.58 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  38.57 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  35.35 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  37.74 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  33.9 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0345  transcriptional regulator, MerR family  28.24 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  28.33 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  26.92 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  40.54 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  22.22 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  30.84 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  35.9 
 
 		 283 aa  62  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 252 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  32.2 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  29.91 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 141 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 148 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 148 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  41.1 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  31.17 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  33.65 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>