More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0690 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0690  penicillin-binding protein  100 
 
 
611 aa  1242    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.611151  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0055  hypothetical protein  89.2 
 
 
610 aa  1131    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0702  penicillin-binding protein  60.89 
 
 
606 aa  741    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1671  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.11 
 
 
599 aa  626  1e-178  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1115  penicillin-binding protein  54.56 
 
 
610 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0362  peptidoglycan glycosyltransferase  46.22 
 
 
595 aa  500  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1068  penicillin-binding protein  46.54 
 
 
585 aa  499  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0550  penicillin-binding protein  44.65 
 
 
602 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1406  penicillin-binding protein  44.48 
 
 
602 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.098253  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0629  penicillin-binding protein  45.14 
 
 
579 aa  488  1e-136  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 
656 aa  206  8e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 
670 aa  173  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  30.59 
 
 
577 aa  170  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.3 
 
 
662 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.4 
 
 
660 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.88 
 
 
654 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  27.18 
 
 
653 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.84 
 
 
631 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  30.07 
 
 
575 aa  164  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  25.37 
 
 
581 aa  163  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  26.45 
 
 
607 aa  163  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 
576 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0370  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.92 
 
 
670 aa  160  6e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  31.17 
 
 
575 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 
578 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  28.27 
 
 
713 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  26.78 
 
 
727 aa  158  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.38 
 
 
657 aa  156  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  31.11 
 
 
578 aa  156  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.42 
 
 
582 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  28.3 
 
 
708 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 
583 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.4 
 
 
609 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  31.99 
 
 
578 aa  154  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.27 
 
 
583 aa  154  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  26.48 
 
 
594 aa  153  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.48 
 
 
594 aa  153  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  29.93 
 
 
579 aa  153  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  25.66 
 
 
614 aa  153  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.02 
 
 
645 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  24.92 
 
 
618 aa  153  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  31.01 
 
 
582 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.49 
 
 
702 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.39 
 
 
595 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  25.87 
 
 
652 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 
578 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 
657 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.76 
 
 
561 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  27.73 
 
 
839 aa  151  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1840  peptidoglycan glycosyltransferase  29 
 
 
628 aa  151  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707167  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  30.73 
 
 
578 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  27.79 
 
 
635 aa  150  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  27.3 
 
 
657 aa  150  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  24.7 
 
 
586 aa  150  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1329  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.14 
 
 
566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 
582 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  25.94 
 
 
553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 
578 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  30.07 
 
 
675 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 
580 aa  148  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.26 
 
 
595 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  27.86 
 
 
679 aa  147  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  25.69 
 
 
577 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  28.3 
 
 
556 aa  147  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.56 
 
 
682 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  26.84 
 
 
553 aa  147  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.83 
 
 
657 aa  147  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  26.04 
 
 
754 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  24.62 
 
 
675 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  32.91 
 
 
705 aa  147  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.59 
 
 
577 aa  146  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.64 
 
 
670 aa  146  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  29.16 
 
 
671 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 
675 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.21 
 
 
635 aa  146  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.82 
 
 
680 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  27.89 
 
 
613 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.8 
 
 
607 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  27.89 
 
 
613 aa  144  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  24.38 
 
 
632 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  24.38 
 
 
632 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  24.38 
 
 
632 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  30.49 
 
 
656 aa  144  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  31.99 
 
 
711 aa  144  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.58 
 
 
675 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  29.64 
 
 
578 aa  144  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2151  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.11 
 
 
581 aa  143  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875245  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.29 
 
 
635 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  27.76 
 
 
587 aa  143  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  24.35 
 
 
594 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.86 
 
 
708 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  24.35 
 
 
594 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  29.67 
 
 
579 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  29.31 
 
 
579 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.41 
 
 
644 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  26.91 
 
 
595 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 
553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.6 
 
 
689 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  24.52 
 
 
596 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  27.23 
 
 
642 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>