More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0702 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0055  hypothetical protein  61.58 
 
 
610 aa  740    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0690  penicillin-binding protein  60.89 
 
 
611 aa  741    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.611151  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0702  penicillin-binding protein  100 
 
 
606 aa  1215    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1671  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.76 
 
 
599 aa  601  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1115  penicillin-binding protein  53.18 
 
 
610 aa  581  1e-164  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0550  penicillin-binding protein  46.36 
 
 
602 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1068  penicillin-binding protein  47.23 
 
 
585 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1406  penicillin-binding protein  46.02 
 
 
602 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.098253  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0629  penicillin-binding protein  46.64 
 
 
579 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0362  peptidoglycan glycosyltransferase  44.92 
 
 
595 aa  481  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 
656 aa  170  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.51 
 
 
654 aa  163  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  28 
 
 
670 aa  162  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  28.63 
 
 
660 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  29.49 
 
 
671 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  27.29 
 
 
576 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  29.79 
 
 
575 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 
631 aa  157  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  27.21 
 
 
578 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  30.52 
 
 
657 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  25.98 
 
 
675 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  31.64 
 
 
657 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  27.21 
 
 
607 aa  151  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.37 
 
 
657 aa  151  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  29.1 
 
 
583 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.41 
 
 
662 aa  150  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  27.68 
 
 
578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.61 
 
 
675 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  28.64 
 
 
582 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  24.3 
 
 
653 aa  148  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.32 
 
 
582 aa  148  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0370  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.45 
 
 
670 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.98 
 
 
675 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  30.7 
 
 
579 aa  147  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  27.36 
 
 
839 aa  147  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  28.41 
 
 
582 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  25.43 
 
 
587 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  26.01 
 
 
577 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  24.67 
 
 
652 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  25.87 
 
 
657 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0652  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.74 
 
 
699 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.44 
 
 
607 aa  144  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.86 
 
 
645 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  25.27 
 
 
614 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  31.68 
 
 
711 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  24.92 
 
 
679 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  28.87 
 
 
578 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1840  peptidoglycan glycosyltransferase  26.7 
 
 
628 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707167  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 
680 aa  141  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  29.37 
 
 
580 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.36 
 
 
594 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  27.74 
 
 
580 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 
610 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  25.36 
 
 
594 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.35 
 
 
689 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  27.73 
 
 
578 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  25.83 
 
 
586 aa  137  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.11 
 
 
670 aa  137  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 
578 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.07 
 
 
581 aa  136  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1329  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.6 
 
 
566 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  28.1 
 
 
705 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  28.1 
 
 
695 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  24.57 
 
 
553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.7 
 
 
595 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  28.71 
 
 
613 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  25.96 
 
 
727 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  28 
 
 
583 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  29.6 
 
 
578 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  28.71 
 
 
613 aa  135  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  24.32 
 
 
618 aa  135  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.84 
 
 
588 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  24.35 
 
 
642 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  24.35 
 
 
642 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  30.17 
 
 
575 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  24.57 
 
 
553 aa  134  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  23.73 
 
 
635 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  24.35 
 
 
642 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.1 
 
 
635 aa  134  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3955  peptidoglycan glycosyltransferase  26.85 
 
 
603 aa  133  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.194154  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.53 
 
 
595 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  26.94 
 
 
656 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  29.21 
 
 
577 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  27.97 
 
 
713 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  29.27 
 
 
708 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  24.2 
 
 
577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.89 
 
 
702 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3554  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.89 
 
 
569 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  27.9 
 
 
578 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  23.84 
 
 
571 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  24.74 
 
 
582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.97 
 
 
570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  27.23 
 
 
577 aa  132  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  28.18 
 
 
570 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.38 
 
 
644 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  24.16 
 
 
596 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  26.59 
 
 
580 aa  130  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.92 
 
 
582 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.03 
 
 
708 aa  130  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.8 
 
 
561 aa  130  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>