More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1068 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0629  penicillin-binding protein  77.64 
 
 		 579 aa  938    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0550  penicillin-binding protein  77.99 
 
 		 602 aa  943    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1068  penicillin-binding protein  100 
 
 		 585 aa  1186    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1406  penicillin-binding protein  77.99 
 
 		 602 aa  942    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.098253  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0690  penicillin-binding protein  46.54 
 
 		 611 aa  499  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.611151  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0055  hypothetical protein  45.88 
 
 		 610 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0702  penicillin-binding protein  47.23 
 
 		 606 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1115  penicillin-binding protein  46.73 
 
 		 610 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1671  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.61 
 
 		 599 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0362  peptidoglycan glycosyltransferase  40.21 
 
 		 595 aa  376  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.4 
 
 		 656 aa  187  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0370  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.7 
 
 		 670 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.88 
 
 		 578 aa  184  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  33.14 
 
 		 607 aa  180  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 		 578 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 		 578 aa  177  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  29.21 
 
 		 583 aa  176  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.79 
 
 		 571 aa  176  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 		 662 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  29.06 
 
 		 578 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  29.43 
 
 		 577 aa  174  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  27.49 
 
 		 657 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 582 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  30.84 
 
 		 553 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.68 
 
 		 657 aa  170  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  30.84 
 
 		 553 aa  170  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.27 
 
 		 594 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  28.27 
 
 		 594 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.45 
 
 		 654 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  28.77 
 
 		 578 aa  166  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  28.77 
 
 		 577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  30.28 
 
 		 695 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  28.41 
 
 		 578 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  29.93 
 
 		 580 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  30.55 
 
 		 548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  27.91 
 
 		 671 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30 
 
 		 660 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  30.55 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  29.33 
 
 		 583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 		 631 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  30.9 
 
 		 610 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  30.05 
 
 		 582 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  28.24 
 
 		 581 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  25 
 
 		 670 aa  163  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  28.37 
 
 		 614 aa  161  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  32.51 
 
 		 657 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  30.63 
 
 		 587 aa  161  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  28.78 
 
 		 579 aa  161  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  29.28 
 
 		 570 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  30.25 
 
 		 575 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  28.95 
 
 		 581 aa  160  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.8 
 
 		 584 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.92 
 
 		 702 aa  160  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  26.8 
 
 		 584 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  26.8 
 
 		 584 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  29.43 
 
 		 582 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  30.02 
 
 		 713 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  26.8 
 
 		 584 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.3 
 
 		 588 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  30.3 
 
 		 575 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 		 576 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  29.86 
 
 		 583 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  28.89 
 
 		 580 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  26.59 
 
 		 719 aa  159  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  28.24 
 
 		 583 aa  158  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  29.29 
 
 		 582 aa  158  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0254868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 		 582 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  28.41 
 
 		 583 aa  157  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  28.41 
 
 		 583 aa  157  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  28.41 
 
 		 583 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 		 582 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  31.17 
 
 		 646 aa  156  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  28.92 
 
 		 644 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  30.75 
 
 		 579 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  27.8 
 
 		 582 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.208475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  29.19 
 
 		 578 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  27.54 
 
 		 656 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  30.49 
 
 		 579 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  27.31 
 
 		 577 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  28.71 
 
 		 582 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.96 
 
 		 645 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.71 
 
 		 582 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2515  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.51 
 
 		 584 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.678179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  26.8 
 
 		 613 aa  154  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2895  peptidoglycan synthetase FtsI , putative  26.51 
 
 		 584 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  26.79 
 
 		 568 aa  154  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  29.55 
 
 		 580 aa  154  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  26.6 
 
 		 613 aa  153  7e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  28.67 
 
 		 708 aa  153  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  25.79 
 
 		 675 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0352  peptidoglycan synthetase FtsI  26.83 
 
 		 599 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.03 
 
 		 675 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.79 
 
 		 675 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0134  peptidoglycan glycosyltransferase  28.5 
 
 		 669 aa  152  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  30.93 
 
 		 580 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  26.74 
 
 		 653 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 		 570 aa  150  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.57 
 
 		 570 aa  150  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.4 
 
 		 708 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0523217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>