More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1115 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1115  penicillin-binding protein  100 
 
 
610 aa  1229    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0055  hypothetical protein  55.42 
 
 
610 aa  633  1e-180  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0690  penicillin-binding protein  54.02 
 
 
611 aa  629  1e-179  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.611151  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0702  penicillin-binding protein  53.14 
 
 
606 aa  594  1e-168  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1671  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.28 
 
 
599 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1406  penicillin-binding protein  45.76 
 
 
602 aa  488  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.098253  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0550  penicillin-binding protein  45.42 
 
 
602 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0629  penicillin-binding protein  45.8 
 
 
579 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1068  penicillin-binding protein  46.18 
 
 
585 aa  482  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0362  peptidoglycan glycosyltransferase  42.29 
 
 
595 aa  425  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  28.16 
 
 
607 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  30.28 
 
 
577 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  30.77 
 
 
553 aa  184  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 
578 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  31.74 
 
 
553 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.09 
 
 
654 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 
578 aa  181  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 
631 aa  181  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.73 
 
 
645 aa  180  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  33.74 
 
 
660 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  28.41 
 
 
614 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  32.13 
 
 
583 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  31.08 
 
 
575 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 
576 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.58 
 
 
656 aa  178  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  29.35 
 
 
578 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 
582 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  31.8 
 
 
578 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.06 
 
 
582 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  29.76 
 
 
578 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  30.24 
 
 
582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 
578 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 
582 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 
671 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.64 
 
 
571 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  29.71 
 
 
578 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  30.46 
 
 
575 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  29.75 
 
 
583 aa  171  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  25.72 
 
 
578 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  28.89 
 
 
577 aa  169  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  27.35 
 
 
580 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 
653 aa  167  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.99 
 
 
588 aa  167  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  30.12 
 
 
579 aa  167  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 
675 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3955  peptidoglycan glycosyltransferase  27.26 
 
 
603 aa  167  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.194154  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  30.79 
 
 
675 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  27.6 
 
 
586 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.83 
 
 
635 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 
675 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.44 
 
 
609 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0370  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.18 
 
 
670 aa  165  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  30.19 
 
 
579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  30.19 
 
 
579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 
582 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0254868  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  29.11 
 
 
594 aa  164  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.11 
 
 
594 aa  164  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.58 
 
 
595 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 
662 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  29.52 
 
 
581 aa  162  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 
587 aa  162  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 
582 aa  161  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.208475  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  25.86 
 
 
577 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 
635 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 
590 aa  160  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  25.14 
 
 
596 aa  160  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  31.39 
 
 
595 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 
642 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 
642 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 
642 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  27.29 
 
 
613 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.9 
 
 
680 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  24.95 
 
 
594 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  24.95 
 
 
594 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  24.95 
 
 
594 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  29.52 
 
 
580 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  24.95 
 
 
594 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  24.95 
 
 
594 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 
570 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.6 
 
 
595 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1840  peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 
628 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707167  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.74 
 
 
644 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.88 
 
 
657 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 
652 aa  158  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  24.95 
 
 
594 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  28.54 
 
 
613 aa  158  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  28.39 
 
 
695 aa  158  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  28.32 
 
 
670 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.28 
 
 
581 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  24.76 
 
 
594 aa  158  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.77 
 
 
582 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.14 
 
 
657 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  28.74 
 
 
580 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  26.31 
 
 
679 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.86 
 
 
577 aa  157  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  28.54 
 
 
582 aa  157  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3749  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.65 
 
 
607 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425103  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.44 
 
 
583 aa  157  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  30.92 
 
 
570 aa  157  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.75 
 
 
637 aa  157  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>