More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0055 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0690  penicillin-binding protein  89.2 
 
 		 611 aa  1131    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.611151  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0055  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1235    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0702  penicillin-binding protein  61.58 
 
 		 606 aa  740    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1115  penicillin-binding protein  55.99 
 
 		 610 aa  619  1e-176  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1671  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.6 
 
 		 599 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1068  penicillin-binding protein  45.88 
 
 		 585 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0362  peptidoglycan glycosyltransferase  45.7 
 
 		 595 aa  488  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1406  penicillin-binding protein  44.16 
 
 		 602 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.098253  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0550  penicillin-binding protein  44.33 
 
 		 602 aa  481  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0629  penicillin-binding protein  44.37 
 
 		 579 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 656 aa  193  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 		 631 aa  173  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.78 
 
 		 662 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  28.79 
 
 		 713 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  31.36 
 
 		 577 aa  163  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.55 
 
 		 660 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  26.66 
 
 		 607 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  31.54 
 
 		 575 aa  158  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 		 654 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 		 576 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  28.97 
 
 		 670 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  31.36 
 
 		 575 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.04 
 
 		 583 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.09 
 
 		 657 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.06 
 
 		 581 aa  152  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1329  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.25 
 
 		 566 aa  151  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 		 582 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.55 
 
 		 609 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  25.42 
 
 		 679 aa  150  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  25.91 
 
 		 653 aa  150  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  30.85 
 
 		 579 aa  150  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.72 
 
 		 645 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  27.76 
 
 		 708 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  25.04 
 
 		 652 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  30.28 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  27.68 
 
 		 586 aa  148  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  30.33 
 
 		 578 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 		 578 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 578 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 		 675 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  28.4 
 
 		 839 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  29.5 
 
 		 578 aa  146  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  28.52 
 
 		 657 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 675 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  29.72 
 
 		 578 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  24.42 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 614 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  32.67 
 
 		 711 aa  144  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 		 705 aa  144  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.85 
 
 		 682 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.7 
 
 		 561 aa  144  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.75 
 
 		 594 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  29.15 
 
 		 727 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 		 635 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  30.11 
 
 		 580 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.49 
 
 		 583 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.73 
 
 		 675 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  24.75 
 
 		 594 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0370  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.25 
 
 		 670 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  29.1 
 
 		 587 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.97 
 
 		 657 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  29.43 
 
 		 579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  26.42 
 
 		 657 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 		 578 aa  142  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  29.43 
 
 		 579 aa  142  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  24.59 
 
 		 577 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  27.17 
 
 		 553 aa  140  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.55 
 
 		 702 aa  140  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2151  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.63 
 
 		 581 aa  140  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  25.17 
 
 		 642 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  25.17 
 
 		 642 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  25.17 
 
 		 642 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  23.8 
 
 		 635 aa  140  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  27.17 
 
 		 553 aa  140  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1840  peptidoglycan glycosyltransferase  28.31 
 
 		 628 aa  140  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0480  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 		 574 aa  140  8.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.63 
 
 		 582 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  24.84 
 
 		 582 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  29.41 
 
 		 580 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  28.97 
 
 		 675 aa  139  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.17 
 
 		 577 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.73 
 
 		 588 aa  139  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 		 613 aa  139  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 		 613 aa  139  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.87 
 
 		 689 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  28.64 
 
 		 671 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.42 
 
 		 644 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 		 680 aa  137  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.34 
 
 		 754 aa  136  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.28 
 
 		 670 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3749  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 		 607 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.41 
 
 		 607 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0134  peptidoglycan glycosyltransferase  28.75 
 
 		 669 aa  135  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3955  peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 		 603 aa  135  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.194154  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 		 553 aa  135  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  27.08 
 
 		 575 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  29.49 
 
 		 582 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1850  putative peptidoglycan synthetase (pbp transpeptidase domain)  28.69 
 
 		 598 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.570485  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  23.91 
 
 		 710 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.49 
 
 		 582 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>