More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1329 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1329  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
566 aa  1145    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  32.46 
 
 
657 aa  323  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.64 
 
 
657 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.04 
 
 
662 aa  297  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0853  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 
578 aa  289  1e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0544989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.99 
 
 
657 aa  286  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 
657 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  32.68 
 
 
729 aa  277  4e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  32.07 
 
 
660 aa  276  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.3 
 
 
654 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 
582 aa  272  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  32.64 
 
 
656 aa  265  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.36 
 
 
703 aa  260  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  34.99 
 
 
649 aa  259  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  32.98 
 
 
711 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 
710 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 
588 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  32.2 
 
 
695 aa  250  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  29.84 
 
 
586 aa  249  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.2 
 
 
571 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 
690 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  29.04 
 
 
671 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  32.12 
 
 
708 aa  242  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.07 
 
 
644 aa  242  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 
631 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 
708 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 
675 aa  240  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  33.59 
 
 
705 aa  240  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  30.23 
 
 
631 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  29.05 
 
 
618 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.84 
 
 
654 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1853  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.63 
 
 
624 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  29.98 
 
 
734 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  30.71 
 
 
740 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  30.4 
 
 
582 aa  233  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  32.89 
 
 
682 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 
553 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  29.88 
 
 
632 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  29.88 
 
 
632 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  29.88 
 
 
632 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  31.51 
 
 
723 aa  231  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  31.48 
 
 
713 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.54 
 
 
645 aa  229  7e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1254  peptidoglycan glycosyltransferase  30.04 
 
 
562 aa  229  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  28.14 
 
 
607 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  28.45 
 
 
577 aa  228  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  30.83 
 
 
570 aa  227  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 
689 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  30.55 
 
 
719 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 
730 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  28.45 
 
 
594 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  28.3 
 
 
614 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  28.45 
 
 
594 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  28.27 
 
 
594 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 
672 aa  224  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  28.3 
 
 
596 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  27.07 
 
 
577 aa  223  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  31.23 
 
 
638 aa  223  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  32.75 
 
 
708 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  29.18 
 
 
630 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  28.27 
 
 
594 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  28.27 
 
 
594 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  28.27 
 
 
594 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  28.15 
 
 
580 aa  223  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  28.27 
 
 
594 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  28.72 
 
 
581 aa  223  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  28.1 
 
 
582 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  29.23 
 
 
653 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  29.2 
 
 
630 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.72 
 
 
582 aa  219  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  28.8 
 
 
638 aa  218  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.99 
 
 
577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.14 
 
 
675 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  30.16 
 
 
645 aa  217  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.81 
 
 
607 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.08 
 
 
570 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  28.94 
 
 
624 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.96 
 
 
675 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  28.94 
 
 
675 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  27.15 
 
 
580 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  27.75 
 
 
595 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0866  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.82 
 
 
562 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.07417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  30.35 
 
 
638 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  30.35 
 
 
638 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 
727 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  27.42 
 
 
578 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  28.72 
 
 
610 aa  214  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.67 
 
 
621 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.94 
 
 
582 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.85 
 
 
595 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  27.94 
 
 
582 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  30.18 
 
 
638 aa  213  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  30.2 
 
 
670 aa  213  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  30.18 
 
 
638 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  30.18 
 
 
638 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  30.18 
 
 
638 aa  213  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  30.18 
 
 
638 aa  213  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.67 
 
 
595 aa  213  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  30.18 
 
 
638 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  27.74 
 
 
578 aa  213  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>