More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0629 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0629  penicillin-binding protein  100 
 
 
579 aa  1172    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1406  penicillin-binding protein  98.62 
 
 
602 aa  1160    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.098253  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0550  penicillin-binding protein  99.65 
 
 
602 aa  1170    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1068  penicillin-binding protein  77.64 
 
 
585 aa  938    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0702  penicillin-binding protein  46.64 
 
 
606 aa  486  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0690  penicillin-binding protein  45.14 
 
 
611 aa  488  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.611151  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0055  hypothetical protein  44.37 
 
 
610 aa  473  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1115  penicillin-binding protein  45.98 
 
 
610 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1671  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.39 
 
 
599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0362  peptidoglycan glycosyltransferase  39.61 
 
 
595 aa  377  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.07 
 
 
657 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.94 
 
 
654 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30.13 
 
 
660 aa  177  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  26.42 
 
 
578 aa  176  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.4 
 
 
662 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  27.29 
 
 
578 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  29.81 
 
 
583 aa  173  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.55 
 
 
656 aa  172  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  28.85 
 
 
607 aa  171  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  26.86 
 
 
578 aa  170  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  30.77 
 
 
657 aa  170  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  27.69 
 
 
576 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  26.98 
 
 
575 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  29 
 
 
577 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  30.7 
 
 
548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  30.7 
 
 
552 aa  168  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.05 
 
 
594 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  26.05 
 
 
594 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  30.12 
 
 
553 aa  167  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  30.35 
 
 
553 aa  167  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  25.55 
 
 
578 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 
614 aa  167  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  28.98 
 
 
578 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.74 
 
 
645 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  31.75 
 
 
657 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  29.69 
 
 
579 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  29.04 
 
 
583 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  26.52 
 
 
575 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  29.22 
 
 
579 aa  164  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.78 
 
 
571 aa  163  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0370  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.7 
 
 
670 aa  163  7e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.31 
 
 
588 aa  163  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  28.63 
 
 
578 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  27.88 
 
 
587 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 
582 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  30.02 
 
 
582 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 
587 aa  161  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 
582 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  28.74 
 
 
580 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  28.06 
 
 
579 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  25.74 
 
 
577 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  25 
 
 
583 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  25.33 
 
 
618 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  25.72 
 
 
670 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.56 
 
 
702 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  30.26 
 
 
631 aa  158  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  27.79 
 
 
578 aa  158  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  27.88 
 
 
580 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 
582 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0254868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.55 
 
 
582 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  28.67 
 
 
570 aa  157  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  25.18 
 
 
583 aa  157  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  25.18 
 
 
583 aa  157  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  25.18 
 
 
583 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  29.82 
 
 
610 aa  157  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.77 
 
 
584 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  24.77 
 
 
584 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  24.77 
 
 
584 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  24.45 
 
 
583 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  24.77 
 
 
584 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  27.91 
 
 
671 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  27.9 
 
 
653 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  24.87 
 
 
632 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  24.87 
 
 
632 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  24.87 
 
 
632 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  24.91 
 
 
596 aa  153  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  29.5 
 
 
582 aa  153  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.208475  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  29.59 
 
 
595 aa  153  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  31.51 
 
 
601 aa  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  26.12 
 
 
577 aa  152  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0134  peptidoglycan glycosyltransferase  29.75 
 
 
669 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  24.83 
 
 
568 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  24.65 
 
 
577 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  24.66 
 
 
581 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  27.72 
 
 
646 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  25.09 
 
 
594 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  25.09 
 
 
594 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  29.06 
 
 
656 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  25.09 
 
 
594 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  25.05 
 
 
630 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  25.09 
 
 
594 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  26.03 
 
 
580 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  25.09 
 
 
594 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  25.05 
 
 
630 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  25.09 
 
 
594 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  30.73 
 
 
597 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  30.07 
 
 
600 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  29.09 
 
 
605 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.6 
 
 
577 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  24.91 
 
 
594 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>