More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1495 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  64.32 
 
 
914 aa  1081    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  73.57 
 
 
871 aa  1067    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  73.44 
 
 
871 aa  1065    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  68.2 
 
 
854 aa  1116    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  47.38 
 
 
874 aa  779    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  69 
 
 
877 aa  1147    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 
822 aa  638    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  59.05 
 
 
888 aa  985    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  84.18 
 
 
903 aa  1466    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
885 aa  1769    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  67.27 
 
 
838 aa  1096    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  50.71 
 
 
947 aa  627  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  54.76 
 
 
924 aa  628  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  48.16 
 
 
892 aa  624  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  51.5 
 
 
1029 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.39 
 
 
732 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.04 
 
 
692 aa  621  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  52.86 
 
 
739 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  51.67 
 
 
903 aa  616  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 
920 aa  615  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52.39 
 
 
883 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  51.79 
 
 
1079 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  52.83 
 
 
945 aa  612  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 
884 aa  612  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  51.89 
 
 
1161 aa  610  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  52.89 
 
 
971 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 
979 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  51.62 
 
 
997 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 
882 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  48.32 
 
 
897 aa  600  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  49.15 
 
 
975 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  49.15 
 
 
975 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  49.3 
 
 
975 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  49.3 
 
 
975 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  50.81 
 
 
984 aa  601  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  52.95 
 
 
985 aa  602  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  49.15 
 
 
975 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  49.15 
 
 
975 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  49.3 
 
 
975 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  40.24 
 
 
882 aa  599  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  50.73 
 
 
965 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  48.91 
 
 
752 aa  598  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  50.32 
 
 
976 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  41.87 
 
 
845 aa  597  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  50.32 
 
 
969 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 
686 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 
964 aa  593  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 
686 aa  593  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 
686 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  48.48 
 
 
964 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  51.56 
 
 
986 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 
686 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 
689 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 
989 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 
964 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 
971 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  51.91 
 
 
980 aa  595  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 
984 aa  595  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  49.11 
 
 
943 aa  594  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  49.68 
 
 
971 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  50.33 
 
 
986 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 
971 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  48.61 
 
 
971 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 
686 aa  592  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 
686 aa  592  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 
686 aa  592  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  48.3 
 
 
907 aa  591  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  52.31 
 
 
1079 aa  591  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  49.84 
 
 
921 aa  590  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  51.98 
 
 
940 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  49.68 
 
 
972 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 
896 aa  586  1e-166  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  51.65 
 
 
705 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  48.45 
 
 
972 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 
686 aa  587  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 
879 aa  588  1e-166  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  49.08 
 
 
688 aa  585  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  47.99 
 
 
943 aa  587  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  47.88 
 
 
885 aa  585  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  51.65 
 
 
705 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 
953 aa  588  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 
688 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 
966 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  47.87 
 
 
915 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 
888 aa  585  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  48.15 
 
 
956 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 
943 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  53.75 
 
 
1035 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  48.37 
 
 
889 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  48.21 
 
 
885 aa  580  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 
875 aa  582  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  47.88 
 
 
880 aa  579  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 
943 aa  582  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  48.54 
 
 
992 aa  581  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  48.25 
 
 
885 aa  582  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  51.63 
 
 
929 aa  579  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  46.29 
 
 
936 aa  582  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 
875 aa  582  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  47.66 
 
 
828 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  47.64 
 
 
882 aa  582  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>