More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0352 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  799    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  39.41 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  39.41 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  46.12 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  34.97 
 
 		 390 aa  202  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  37.4 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  33.68 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  34.32 
 
 		 390 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  35.32 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  35.23 
 
 		 390 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  34.95 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  34.66 
 
 		 389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  38.34 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  35.58 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.19 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 392 aa  192  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  38.52 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  37.43 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  34.51 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  36.8 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  34.41 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  35.04 
 
 		 390 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  34.39 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  33.85 
 
 		 385 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  36.51 
 
 		 383 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  34.54 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  33.87 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  35.42 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  34.94 
 
 		 388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  34.2 
 
 		 395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  37.3 
 
 		 402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  35.71 
 
 		 381 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.12 
 
 		 387 aa  183  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  33.7 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  33.16 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  36.19 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  35.04 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  32.89 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.16 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  37.16 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  32.63 
 
 		 385 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.37 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  34.89 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  32.63 
 
 		 385 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  32.63 
 
 		 385 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.47 
 
 		 383 aa  176  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.95 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  34.81 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  35.24 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  34.57 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  32.42 
 
 		 379 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  33.77 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  33.52 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  34.14 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.7 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  31.11 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.16 
 
 		 378 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  33.16 
 
 		 390 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  34.44 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  33.69 
 
 		 384 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  31.93 
 
 		 379 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  32.34 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  32.38 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  32.18 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  31.77 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.7 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  34.8 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  32.89 
 
 		 382 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  32.8 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  34.81 
 
 		 382 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  29.58 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.66 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  34.27 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  30.65 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  41.2 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  32.62 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  31.9 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.04 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.88 
 
 		 380 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  32.89 
 
 		 548 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  32.49 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  30.45 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  33.15 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  40.64 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  31.91 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  33.91 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.4 
 
 		 390 aa  143  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  32.77 
 
 		 388 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  33.92 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  30.35 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  31.5 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.83 
 
 		 388 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.83 
 
 		 388 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  31.17 
 
 		 386 aa  139  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  32.8 
 
 		 550 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  32.8 
 
 		 550 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  32.8 
 
 		 550 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  28.92 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>